86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4859 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0737    98.55 
 
 		 839 bp  771    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4859    100 
 
 		 440 bp  872    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3715    98.79 
 
 		 836 bp  779    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  94.16 
 
 		 840 bp  617  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  94.16 
 
 		 906 bp  617  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0717    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.194126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2733    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2604    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1694    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0579778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2599    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2513    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2308    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2275    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0689    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000564033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0907    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0188998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1019    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2160    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0153197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1300    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1362    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  93.92 
 
 		 522 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1639    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1686    93.92 
 
 		 417 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00193131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2981    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0145761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3110    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4756    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4639    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4080    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4617    93.92 
 
 		 840 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.418974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3018    93.67 
 
 		 840 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0232    93.67 
 
 		 840 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0251    93.67 
 
 		 840 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0128    93.67 
 
 		 840 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3300    93.67 
 
 		 840 bp  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0069    94.18 
 
 		 822 bp  593  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000143037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3326    93.19 
 
 		 417 bp  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.783676  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4926    94.29 
 
 		 819 bp  555  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1241    94.19 
 
 		 435 bp  509  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.571069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0697    94.19 
 
 		 765 bp  509  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000144069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4661  hypothetical protein  93.45 
 
 		 540 bp  484  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4762    95.62 
 
 		 726 bp  402  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0089    95.62 
 
 		 726 bp  402  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1563    95.62 
 
 		 726 bp  402  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0304    95.62 
 
 		 726 bp  402  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0580008  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1668    95.62 
 
 		 726 bp  402  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.712309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1769    95.62 
 
 		 726 bp  402  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.680483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0881    86.23 
 
 		 1169 bp  361  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0224    96.28 
 
 		 744 bp  355  7e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0016    86.17 
 
 		 840 bp  351  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04151    98.31 
 
 		 597 bp  327  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  98.31 
 
 		 597 bp  327  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1593    95.89 
 
 		 609 bp  234  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04115  hypothetical protein  100 
 
 		 414 bp  141  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04152  predicted protein  100 
 
 		 414 bp  141  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  92.31 
 
 		 687 bp  89.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  87.5 
 
 		 747 bp  71.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  86.67 
 
 		 747 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  86.67 
 
 		 747 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  89.29 
 
 		 735 bp  63.9  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  88.14 
 
 		 747 bp  61.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  88.14 
 
 		 540 bp  61.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  88.14 
 
 		 747 bp  61.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  94.74 
 
 		 870 bp  60  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2965  alpha-ketoglutarate permease  100 
 
 		 948 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.786706  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  85.29 
 
 		 759 bp  56  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1118    100 
 
 		 135 bp  54  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4651  hypothetical protein  100 
 
 		 141 bp  54  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2635  hypothetical protein  100 
 
 		 117 bp  54  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0439453  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  100 
 
 		 1188 bp  54  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  90.48 
 
 		 831 bp  52  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  90.48 
 
 		 831 bp  52  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  90.48 
 
 		 831 bp  52  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  90.48 
 
 		 831 bp  52  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0359    96.55 
 
 		 804 bp  50.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 804 bp  50.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 804 bp  50.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 810 bp  50.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 		 816 bp  48.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 		 816 bp  48.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 		 816 bp  48.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  91.43 
 
 		 810 bp  46.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>