More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1889 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  100 
 
 
179 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  99.4 
 
 
248 aa  353  7.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  99.4 
 
 
248 aa  353  7.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  96.41 
 
 
248 aa  343  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  96.41 
 
 
248 aa  343  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  92.81 
 
 
248 aa  333  9e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  64.67 
 
 
244 aa  247  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  67.66 
 
 
290 aa  246  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  67.66 
 
 
290 aa  246  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  67.66 
 
 
290 aa  246  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  67.66 
 
 
290 aa  246  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  67.66 
 
 
290 aa  246  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  63.47 
 
 
277 aa  246  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  63.47 
 
 
277 aa  246  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  63.47 
 
 
277 aa  246  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  64.07 
 
 
270 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  64.07 
 
 
270 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  64.07 
 
 
270 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  64.07 
 
 
270 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  64.07 
 
 
270 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  64.07 
 
 
270 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  64.07 
 
 
270 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  64.07 
 
 
270 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  64.07 
 
 
270 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  61.68 
 
 
392 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  61.68 
 
 
392 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  61.68 
 
 
392 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  65.27 
 
 
253 aa  241  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  62.28 
 
 
270 aa  241  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  62.28 
 
 
270 aa  241  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  61.68 
 
 
270 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  61.68 
 
 
270 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  61.68 
 
 
270 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  61.68 
 
 
270 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  61.68 
 
 
270 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  61.68 
 
 
270 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  61.68 
 
 
270 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  61.68 
 
 
270 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  60.71 
 
 
277 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  61.68 
 
 
270 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  62.79 
 
 
271 aa  236  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  62.79 
 
 
271 aa  236  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  62.79 
 
 
271 aa  236  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  64.38 
 
 
252 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  65.38 
 
 
279 aa  231  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  65.38 
 
 
301 aa  231  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  61.08 
 
 
289 aa  230  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  62.05 
 
 
173 aa  228  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  62.05 
 
 
279 aa  228  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  62.82 
 
 
278 aa  224  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  61.29 
 
 
269 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  61.29 
 
 
269 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  61.29 
 
 
269 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  61.29 
 
 
269 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  61.29 
 
 
269 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  61.29 
 
 
269 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  61.29 
 
 
269 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  59.15 
 
 
276 aa  218  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  56.29 
 
 
269 aa  217  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  58.54 
 
 
276 aa  217  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  58.54 
 
 
276 aa  217  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  58.54 
 
 
276 aa  217  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  58.54 
 
 
276 aa  217  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  58.54 
 
 
276 aa  216  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  60.65 
 
 
275 aa  214  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  60.65 
 
 
275 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  60.65 
 
 
275 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  60.65 
 
 
275 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  60.65 
 
 
303 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  60.65 
 
 
275 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  60 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  60 
 
 
275 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  60.78 
 
 
272 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  59.35 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  59.74 
 
 
429 aa  210  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  61.54 
 
 
275 aa  209  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  58.71 
 
 
281 aa  204  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  58.06 
 
 
281 aa  200  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 
260 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 
260 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 
260 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  49.68 
 
 
269 aa  175  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  49.68 
 
 
269 aa  175  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  49.68 
 
 
269 aa  175  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4661  hypothetical protein  68.63 
 
 
179 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  62 
 
 
203 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  47.65 
 
 
378 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  47.65 
 
 
378 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  47.65 
 
 
378 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  47.65 
 
 
378 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0425  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
269 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1049  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
269 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3021  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
269 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4312  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
251 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  46.5 
 
 
271 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0656  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
269 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1727  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
269 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1928  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
269 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4449  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
269 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0972291  normal  0.591502 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4460  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
269 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>