More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_04114 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  98.1 
 
 
279 aa  323  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  98.1 
 
 
301 aa  323  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  97.47 
 
 
279 aa  320  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  62.82 
 
 
392 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  64.47 
 
 
277 aa  214  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  64.47 
 
 
277 aa  214  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  64.47 
 
 
277 aa  214  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  62.82 
 
 
392 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  62.82 
 
 
392 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  62.82 
 
 
270 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  62.82 
 
 
270 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  62.82 
 
 
203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  62.82 
 
 
270 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  62.82 
 
 
270 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  62.82 
 
 
270 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  62.82 
 
 
270 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  62.82 
 
 
270 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  62.82 
 
 
270 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3349  IS911 orfA  98.04 
 
 
141 aa  210  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  62.82 
 
 
270 aa  210  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  62.82 
 
 
270 aa  210  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
270 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
270 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
270 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
270 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
270 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
270 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
270 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
270 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
270 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  60.9 
 
 
290 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  62.18 
 
 
270 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  60.9 
 
 
290 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  60.9 
 
 
290 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  60.9 
 
 
290 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  60.9 
 
 
290 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  69.78 
 
 
244 aa  205  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  64.14 
 
 
253 aa  201  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  59.33 
 
 
289 aa  198  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  57.59 
 
 
276 aa  195  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  57.59 
 
 
276 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  57.59 
 
 
276 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  57.59 
 
 
276 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  57.59 
 
 
276 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  56.33 
 
 
276 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  56.33 
 
 
278 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  62.41 
 
 
252 aa  192  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  56.96 
 
 
271 aa  190  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  56.96 
 
 
271 aa  190  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  56.96 
 
 
271 aa  190  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  57.89 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  55.24 
 
 
248 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  55.24 
 
 
248 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  58.21 
 
 
248 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  58.21 
 
 
248 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  57.46 
 
 
248 aa  167  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  52.8 
 
 
272 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  52.47 
 
 
260 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  52.47 
 
 
260 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  52.47 
 
 
260 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  48.5 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  48.5 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  48.5 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  48.5 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  48.5 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  48.5 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  48.5 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  50.62 
 
 
284 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  50.93 
 
 
281 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  48.21 
 
 
269 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  54.48 
 
 
275 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  53.79 
 
 
275 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  53.79 
 
 
275 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  53.79 
 
 
275 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  54.17 
 
 
275 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  54.48 
 
 
303 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  53.79 
 
 
275 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  47.02 
 
 
275 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  52.38 
 
 
281 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  50.34 
 
 
429 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  53.1 
 
 
281 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  47.26 
 
 
269 aa  142  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  47.26 
 
 
269 aa  142  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  47.26 
 
 
269 aa  142  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0234  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
195 aa  141  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.100698 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  92.86 
 
 
173 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  38.69 
 
 
378 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  38.69 
 
 
378 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  38.69 
 
 
378 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  38.69 
 
 
378 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  35.22 
 
 
285 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  35.26 
 
 
281 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  34.59 
 
 
277 aa  97.1  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3233  putative transposase protein  48.21 
 
 
124 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  37.11 
 
 
271 aa  95.1  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0081  hypothetical protein  43.36 
 
 
135 aa  94.7  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.773542 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  36.62 
 
 
386 aa  94.7  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  36.62 
 
 
386 aa  94.7  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  36.62 
 
 
386 aa  94.7  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>