More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0757 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  100 
 
 
269 aa  564  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  100 
 
 
269 aa  564  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  100 
 
 
269 aa  564  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  100 
 
 
269 aa  564  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  100 
 
 
269 aa  564  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  100 
 
 
269 aa  564  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  100 
 
 
269 aa  564  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  66.54 
 
 
269 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  68.16 
 
 
275 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  68.16 
 
 
275 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  68.16 
 
 
275 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  67.79 
 
 
275 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  67.79 
 
 
275 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  67.79 
 
 
275 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  67.67 
 
 
303 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  67.45 
 
 
272 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  64.68 
 
 
281 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  67.42 
 
 
281 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  67.04 
 
 
281 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  65.92 
 
 
275 aa  367  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  62.6 
 
 
284 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  60.3 
 
 
429 aa  355  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  53.28 
 
 
290 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  53.28 
 
 
290 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  53.28 
 
 
290 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  53.28 
 
 
290 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  53.28 
 
 
290 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  54.44 
 
 
279 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  54.02 
 
 
301 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  54.05 
 
 
279 aa  294  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  51.94 
 
 
392 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  51.94 
 
 
392 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  51.94 
 
 
392 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  52.17 
 
 
270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  52.17 
 
 
270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  52.17 
 
 
270 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  52.17 
 
 
270 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  52.17 
 
 
270 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  52.17 
 
 
270 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  52.17 
 
 
270 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  52.17 
 
 
270 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  52.57 
 
 
270 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  52.57 
 
 
270 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  52.57 
 
 
270 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  52.57 
 
 
270 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  52.57 
 
 
270 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  52.57 
 
 
270 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  52.57 
 
 
270 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  52.57 
 
 
270 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  52.57 
 
 
270 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  52.17 
 
 
270 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  52.72 
 
 
253 aa  285  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  51.78 
 
 
270 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  51.78 
 
 
270 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  52.11 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  55.6 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  55.6 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  56.58 
 
 
244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  49.81 
 
 
289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  51.15 
 
 
276 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  55.17 
 
 
248 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  55.17 
 
 
248 aa  280  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  50.38 
 
 
278 aa  278  5e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  51.15 
 
 
276 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  51.15 
 
 
276 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  51.15 
 
 
276 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  51.15 
 
 
276 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  53.02 
 
 
248 aa  272  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  50 
 
 
271 aa  270  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  50 
 
 
271 aa  270  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  50 
 
 
271 aa  270  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  49.42 
 
 
277 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  53.33 
 
 
252 aa  263  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  51.18 
 
 
260 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  51.18 
 
 
260 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  51.18 
 
 
260 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  47.86 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  47.86 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  47.86 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
378 aa  234  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
378 aa  234  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
378 aa  234  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
378 aa  234  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  51.5 
 
 
203 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  60.38 
 
 
173 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  61.29 
 
 
179 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  40.44 
 
 
386 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  40.44 
 
 
386 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  40.44 
 
 
386 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  40.44 
 
 
386 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  40.44 
 
 
386 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  40.44 
 
 
386 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0983  ISSod1, transposase OrfB  40.59 
 
 
269 aa  192  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1024  ISSod1, transposase OrfB  40.59 
 
 
269 aa  192  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2171  ISSod1, transposase OrfB  40.59 
 
 
269 aa  192  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2315  ISSod1, transposase OrfB  40.59 
 
 
269 aa  192  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2369  ISSod1, transposase OrfB  40.59 
 
 
269 aa  192  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>