More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3233 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3233  putative transposase protein  100 
 
 		 124 aa  254  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  86.11 
 
 		 284 aa  191  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  69.44 
 
 		 272 aa  156  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  63.64 
 
 		 281 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  69.09 
 
 		 281 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  69.09 
 
 		 275 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  69.09 
 
 		 275 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  69.09 
 
 		 275 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  69.09 
 
 		 275 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  69.09 
 
 		 275 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  69.09 
 
 		 281 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  63.64 
 
 		 269 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  69.09 
 
 		 275 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  68.18 
 
 		 303 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  61.82 
 
 		 429 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  55.45 
 
 		 275 aa  123  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  53.27 
 
 		 269 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  53.27 
 
 		 269 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  53.27 
 
 		 269 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  53.27 
 
 		 269 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  53.27 
 
 		 269 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  53.27 
 
 		 269 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  53.27 
 
 		 269 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  48.21 
 
 		 198 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3349  IS911 orfA  47.41 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28870  hypothetical protein  63.1 
 
 		 98 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000145235  decreased coverage  0.000000000168739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  47.41 
 
 		 279 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  47.41 
 
 		 279 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  47.41 
 
 		 301 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 276 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 276 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 276 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  44.35 
 
 		 276 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  38.26 
 
 		 290 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  41.74 
 
 		 276 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  38.26 
 
 		 290 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  38.26 
 
 		 290 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  38.26 
 
 		 290 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  38.26 
 
 		 290 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  41.74 
 
 		 276 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  43.43 
 
 		 277 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  39.13 
 
 		 278 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  39.83 
 
 		 270 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  39.83 
 
 		 270 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  39.83 
 
 		 270 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  39.83 
 
 		 270 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  39.83 
 
 		 270 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  39.83 
 
 		 270 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  39.83 
 
 		 270 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  39.83 
 
 		 270 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  40.17 
 
 		 271 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  40.17 
 
 		 271 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  40.17 
 
 		 271 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  39.83 
 
 		 270 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  39.83 
 
 		 203 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 277 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 277 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 277 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  41.05 
 
 		 253 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  38.98 
 
 		 270 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  38.98 
 
 		 270 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  41.12 
 
 		 392 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  41.12 
 
 		 392 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  41.12 
 
 		 392 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 270 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  37.39 
 
 		 289 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  39.78 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  39.78 
 
 		 248 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  39.78 
 
 		 248 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  39.78 
 
 		 248 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  39.78 
 
 		 248 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  38.02 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  38.04 
 
 		 252 aa  71.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1886  IS3 family transposase  37 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250279 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0081  hypothetical protein  38.54 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.773542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  39.33 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  39.33 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  39.33 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0234  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0983  ISSod1, transposase OrfB  35.29 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2135  ISSod1, transposase OrfB  35.29 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2169  ISSod1, transposase OrfB  35.29 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2171  ISSod1, transposase OrfB  35.29 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2315  ISSod1, transposase OrfB  35.29 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0145  ISSod1, transposase OrfB  35.29 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>