More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3017 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 270 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 270 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 270 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 270 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 270 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 270 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 270 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 270 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 270 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  96.3 
 
 		 392 aa  557  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  96.3 
 
 		 392 aa  557  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  95.93 
 
 		 392 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  97.04 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  97.04 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  96.67 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  96.67 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  96.67 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  96.67 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  96.67 
 
 		 270 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  96.3 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  96.3 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  96.3 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  96.3 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  70.37 
 
 		 290 aa  418  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  70.37 
 
 		 290 aa  418  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  70.37 
 
 		 290 aa  418  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  70.37 
 
 		 290 aa  418  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  70.37 
 
 		 290 aa  418  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  96.06 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  67.78 
 
 		 289 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  65.8 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  65.8 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  65.8 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  66.54 
 
 		 279 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  66.54 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  67.95 
 
 		 278 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  70.9 
 
 		 244 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  66.17 
 
 		 279 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  64.07 
 
 		 277 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  64.21 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  70.08 
 
 		 253 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  61.94 
 
 		 276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  60.3 
 
 		 276 aa  352  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  60.3 
 
 		 276 aa  352  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  60.3 
 
 		 276 aa  352  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  60.3 
 
 		 276 aa  352  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  60.67 
 
 		 276 aa  349  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  64.81 
 
 		 252 aa  342  4e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  61.29 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  61.29 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  61.29 
 
 		 248 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  60.48 
 
 		 248 aa  332  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  60.48 
 
 		 248 aa  332  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  52.51 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  52.57 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  52.57 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  52.57 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  52.57 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  52.57 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  52.57 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  52.57 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  55.56 
 
 		 275 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  55.13 
 
 		 275 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  55.13 
 
 		 275 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  55.13 
 
 		 275 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  55.13 
 
 		 275 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  55.13 
 
 		 303 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  54.7 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  72.67 
 
 		 173 aa  278  9e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  54.7 
 
 		 281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  49.8 
 
 		 281 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  48.13 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  50.81 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  50.94 
 
 		 269 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  50.94 
 
 		 269 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  50.94 
 
 		 269 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  54.27 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  52.59 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  46.59 
 
 		 429 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  64.07 
 
 		 179 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  61.54 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0234  integrase catalytic subunit  51.03 
 
 		 195 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  44.4 
 
 		 378 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  44.4 
 
 		 378 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  44.4 
 
 		 378 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  44.4 
 
 		 378 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  43.33 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  43.33 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  43.33 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  42.92 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  42.92 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4661  hypothetical protein  71.43 
 
 		 179 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2887  Integrase catalytic region  38.37 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1393  Integrase catalytic region  38.37 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  38.04 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>