More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1453 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  100 
 
 
269 aa  567  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  100 
 
 
269 aa  567  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  100 
 
 
269 aa  567  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0234  integrase catalytic subunit  70.47 
 
 
195 aa  310  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.100698 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  52.26 
 
 
271 aa  285  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  52.26 
 
 
271 aa  285  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  52.26 
 
 
271 aa  285  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  51.7 
 
 
290 aa  278  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  51.7 
 
 
290 aa  278  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  51.7 
 
 
290 aa  278  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  51.7 
 
 
290 aa  278  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  51.7 
 
 
290 aa  278  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
277 aa  275  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
277 aa  275  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
277 aa  275  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  52.97 
 
 
244 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  50.19 
 
 
270 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
270 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
270 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
270 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
270 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
270 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  50.19 
 
 
270 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  50.19 
 
 
270 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  49.81 
 
 
392 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  49.81 
 
 
392 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  50.19 
 
 
270 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  50.19 
 
 
270 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  49.81 
 
 
392 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  49.81 
 
 
270 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  51.45 
 
 
252 aa  265  8e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  51.44 
 
 
253 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  48.87 
 
 
279 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  48.87 
 
 
301 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  48.85 
 
 
277 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  48.5 
 
 
279 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  48.09 
 
 
289 aa  256  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  47.89 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  51.65 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  48.09 
 
 
248 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  51.65 
 
 
276 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  51.65 
 
 
276 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  51.65 
 
 
276 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  51.65 
 
 
276 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  52.84 
 
 
276 aa  247  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  47.88 
 
 
260 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  47.88 
 
 
260 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  47.88 
 
 
260 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  47.86 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  47.86 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  47.86 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  47.86 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  47.86 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  47.86 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  47.86 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  49.58 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  50.64 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  49.16 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  49.16 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  49.16 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  49.16 
 
 
275 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  47.23 
 
 
248 aa  242  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  47.23 
 
 
248 aa  242  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  49.16 
 
 
303 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  48.74 
 
 
275 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  46.15 
 
 
269 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  46.81 
 
 
248 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  46.81 
 
 
248 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  48.74 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  44.62 
 
 
281 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  48.32 
 
 
281 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  47.15 
 
 
429 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  43.7 
 
 
284 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  46.15 
 
 
275 aa  225  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  58.18 
 
 
173 aa  202  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 
378 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 
378 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 
378 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 
378 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  39.48 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  39.48 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  39.48 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  39.48 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  39.48 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  49.51 
 
 
203 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0425  integrase catalytic subunit  43.3 
 
 
269 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1049  integrase catalytic subunit  43.3 
 
 
269 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3021  integrase catalytic subunit  43.3 
 
 
269 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4660  integrase catalytic region  42.53 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.462988  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4596  integrase catalytic region  42.53 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.930794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  42.53 
 
 
386 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>