More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0092 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  100 
 
 		 248 aa  523  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  94.76 
 
 		 248 aa  494  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  94.76 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  94.76 
 
 		 248 aa  494  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  94.76 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  60.08 
 
 		 392 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  60.08 
 
 		 392 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  60.08 
 
 		 392 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  61.29 
 
 		 270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  61.29 
 
 		 270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  61.29 
 
 		 270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  61.29 
 
 		 270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  61.29 
 
 		 270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  61.29 
 
 		 270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  61.29 
 
 		 270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  61.29 
 
 		 270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  61.29 
 
 		 270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  60.48 
 
 		 270 aa  334  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  60.48 
 
 		 270 aa  334  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  60.08 
 
 		 270 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  92.81 
 
 		 179 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  60.08 
 
 		 270 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  60.08 
 
 		 270 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  60.08 
 
 		 270 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  60.08 
 
 		 270 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  60.08 
 
 		 270 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  60.08 
 
 		 270 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  60.08 
 
 		 270 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  60.08 
 
 		 270 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  60.66 
 
 		 277 aa  330  9e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  60.66 
 
 		 277 aa  330  9e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  60.66 
 
 		 277 aa  330  9e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  60.66 
 
 		 244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  62.6 
 
 		 290 aa  325  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  62.6 
 
 		 290 aa  325  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  62.6 
 
 		 290 aa  325  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  62.6 
 
 		 290 aa  325  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  62.6 
 
 		 290 aa  325  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  58.37 
 
 		 277 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  60.09 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  56.5 
 
 		 289 aa  311  7.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  59.59 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  59.59 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  59.59 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  58.23 
 
 		 278 aa  308  6.999999999999999e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  60.59 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  58.61 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  60.59 
 
 		 301 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  60.17 
 
 		 279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  57.44 
 
 		 276 aa  301  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  57.44 
 
 		 276 aa  300  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  56.33 
 
 		 276 aa  299  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  56.33 
 
 		 276 aa  299  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  56.33 
 
 		 276 aa  299  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  56.33 
 
 		 276 aa  299  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  55.13 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  55.13 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  55.13 
 
 		 275 aa  279  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  55.13 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  55.13 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  54.7 
 
 		 303 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  54.7 
 
 		 275 aa  277  9e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  55.26 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  53.02 
 
 		 269 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  53.02 
 
 		 269 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  53.02 
 
 		 269 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  53.02 
 
 		 269 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  53.02 
 
 		 269 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  53.02 
 
 		 269 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  53.02 
 
 		 269 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  51.28 
 
 		 281 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  53.85 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  53.42 
 
 		 281 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  51.28 
 
 		 284 aa  264  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  47.97 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  51.54 
 
 		 429 aa  262  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  54.75 
 
 		 275 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  48.09 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  48.09 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  48.09 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  59.67 
 
 		 203 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  61.18 
 
 		 173 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0234  integrase catalytic subunit  52.91 
 
 		 195 aa  211  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 378 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 378 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 378 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 378 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  40.56 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  38.46 
 
 		 277 aa  178  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1638  integrase catalytic subunit  39.91 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330516  normal  0.0835787 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0425  integrase catalytic subunit  40.09 
 
 		 269 aa  175  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1049  integrase catalytic subunit  40.09 
 
 		 269 aa  175  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3021  integrase catalytic subunit  40.09 
 
 		 269 aa  175  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4312  integrase catalytic subunit  40.09 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4449  integrase catalytic subunit  40.09 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0972291  normal  0.591502 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4460  integrase catalytic subunit  40.09 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0656  integrase catalytic subunit  40.09 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>