More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2313 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2313  transposase  100 
 
 
284 aa  592  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  75.64 
 
 
275 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  75.64 
 
 
275 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  75.64 
 
 
275 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  75.64 
 
 
275 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  76 
 
 
275 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  73.94 
 
 
281 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  75.64 
 
 
275 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  73.59 
 
 
281 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  76.32 
 
 
303 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  74.43 
 
 
272 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  70.29 
 
 
281 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  70.9 
 
 
269 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  68.27 
 
 
429 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  62.6 
 
 
269 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  62.6 
 
 
269 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  62.6 
 
 
269 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  62.6 
 
 
269 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  62.6 
 
 
269 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  62.6 
 
 
269 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  62.6 
 
 
269 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  61.48 
 
 
275 aa  358  8e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  49.09 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  49.09 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  49.09 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  49.09 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  49.09 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  48.36 
 
 
289 aa  293  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  48.55 
 
 
278 aa  292  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  53.96 
 
 
279 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  52.69 
 
 
301 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
277 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
277 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  50.19 
 
 
277 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  49.81 
 
 
276 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  53.58 
 
 
279 aa  287  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  50 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  50 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  50 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  50 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  48.19 
 
 
392 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  48.19 
 
 
392 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  48.19 
 
 
392 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  49.43 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  54.04 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  50.97 
 
 
271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  50.97 
 
 
271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  50.97 
 
 
271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  55.65 
 
 
244 aa  279  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  48.12 
 
 
277 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  50.81 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  50.81 
 
 
270 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  50.4 
 
 
270 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  50.81 
 
 
270 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  50.4 
 
 
270 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
270 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  52.14 
 
 
248 aa  269  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  52.14 
 
 
248 aa  269  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  51.71 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  51.71 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  51.28 
 
 
248 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  50.65 
 
 
252 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  47.88 
 
 
260 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  47.88 
 
 
260 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  47.88 
 
 
260 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  43.7 
 
 
269 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  43.7 
 
 
269 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  43.7 
 
 
269 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  60.13 
 
 
173 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  51.03 
 
 
203 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  60 
 
 
179 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  43.28 
 
 
378 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  43.28 
 
 
378 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  43.28 
 
 
378 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  43.28 
 
 
378 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0093  integrase, putative  92.23 
 
 
104 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3229  transposase, truncation  92.23 
 
 
104 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  41.99 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  41.99 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  41.99 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  41.64 
 
 
293 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  41.64 
 
 
293 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3233  putative transposase protein  86.11 
 
 
124 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  38.85 
 
 
386 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  38.85 
 
 
386 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  38.85 
 
 
386 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>