More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4400 on replicon NC_009661
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  99.49 
 
 
392 aa  817    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  99.49 
 
 
392 aa  817    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
392 aa  822    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  99.63 
 
 
270 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  99.26 
 
 
270 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  99.26 
 
 
270 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  99.26 
 
 
270 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  99.26 
 
 
270 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  99.26 
 
 
270 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  98.89 
 
 
270 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  98.89 
 
 
270 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  98.89 
 
 
270 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  98.52 
 
 
270 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  98.52 
 
 
270 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  95.93 
 
 
270 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  95.93 
 
 
270 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  95.93 
 
 
270 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  95.93 
 
 
270 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  95.93 
 
 
270 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  95.93 
 
 
270 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  95.93 
 
 
270 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  95.93 
 
 
270 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  95.93 
 
 
270 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  68.51 
 
 
290 aa  441  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  68.51 
 
 
290 aa  441  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  68.51 
 
 
290 aa  441  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  68.51 
 
 
290 aa  441  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  68.51 
 
 
290 aa  441  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  65 
 
 
301 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  99.01 
 
 
203 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  67.13 
 
 
289 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  66.19 
 
 
279 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  65.83 
 
 
278 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  65.82 
 
 
277 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  65.82 
 
 
277 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  65.82 
 
 
277 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  65.83 
 
 
279 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  71.31 
 
 
244 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  64.49 
 
 
277 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  69.67 
 
 
253 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  63.1 
 
 
271 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  63.1 
 
 
271 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  63.1 
 
 
271 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  60.44 
 
 
276 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  59.34 
 
 
276 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  59.34 
 
 
276 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  59.34 
 
 
276 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  59.34 
 
 
276 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  60.07 
 
 
276 aa  359  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  64.81 
 
 
252 aa  345  8.999999999999999e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  60.08 
 
 
248 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  60.08 
 
 
248 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  60.08 
 
 
248 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  59.27 
 
 
248 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  59.27 
 
 
248 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  52.43 
 
 
272 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  52.47 
 
 
275 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  52.09 
 
 
275 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  52.09 
 
 
275 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  52.09 
 
 
275 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  52.09 
 
 
275 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  51.94 
 
 
269 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  51.94 
 
 
269 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  51.94 
 
 
269 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  51.94 
 
 
269 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  51.94 
 
 
269 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  51.94 
 
 
269 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  51.94 
 
 
269 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  50.55 
 
 
281 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  51.71 
 
 
275 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  50.18 
 
 
281 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  48.19 
 
 
284 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  49.43 
 
 
281 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  51.29 
 
 
303 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  72.09 
 
 
173 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  52.14 
 
 
275 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  49.61 
 
 
269 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  45.62 
 
 
429 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  49.81 
 
 
269 aa  268  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  49.81 
 
 
269 aa  268  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  49.81 
 
 
269 aa  268  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  40.37 
 
 
378 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  40.37 
 
 
378 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  40.37 
 
 
378 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 
260 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 
260 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  48.84 
 
 
260 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  40.37 
 
 
378 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  61.68 
 
 
179 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  62.82 
 
 
198 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  34.92 
 
 
386 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  34.92 
 
 
386 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  34.92 
 
 
386 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  34.92 
 
 
386 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  34.92 
 
 
386 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  34.92 
 
 
386 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  34.92 
 
 
386 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  34.92 
 
 
386 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  34.92 
 
 
386 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  34.92 
 
 
386 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>