71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04151 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3018    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1593    98.65 
 
 		 609 bp  961    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1639    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1668    98.18 
 
 		 726 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.712309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  98.54 
 
 		 840 bp  1017    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1769    98.18 
 
 		 726 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.680483  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2160    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0153197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2275    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2308    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2513    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2599    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2604    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2733    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2981    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0145761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1694    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0579778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3110    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3300    98 
 
 		 840 bp  993    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4080    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4617    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.418974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4639    98.19 
 
 		 840 bp  1005    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4756    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4762    98.18 
 
 		 726 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4926    98.18 
 
 		 819 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0069    98.18 
 
 		 822 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000143037  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0089    98.18 
 
 		 726 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927604  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0232    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135154  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0304    98.18 
 
 		 726 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0580008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  98.54 
 
 		 906 bp  1017    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  100 
 
 		 597 bp  1183    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0737    95.26 
 
 		 839 bp  880    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04151    100 
 
 		 597 bp  1183    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3715    100 
 
 		 836 bp  1183    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1563    98.18 
 
 		 726 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0128    98 
 
 		 840 bp  993    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0224    98.18 
 
 		 744 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0251    98 
 
 		 840 bp  993    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0689    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000564033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0697    98.18 
 
 		 765 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000144069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0717    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.194126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0907    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0188998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1362    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1238    99.44 
 
 		 459 bp  694    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1019    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1300    98.18 
 
 		 840 bp  1001    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3328    98.4 
 
 		 429 bp  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1922    99.61 
 
 		 339 bp  504  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0016    86.78 
 
 		 840 bp  494  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  96.82 
 
 		 522 bp  482  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0023    99.16 
 
 		 300 bp  456  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4857    92.23 
 
 		 426 bp  422  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3349  IS911 orfA  91.91 
 
 		 426 bp  414  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0881    83.97 
 
 		 1169 bp  383  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4859    98.31 
 
 		 440 bp  327  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1241    95.88 
 
 		 435 bp  313  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.571069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1686    95.51 
 
 		 417 bp  281  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00193131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3326    94.38 
 
 		 417 bp  266  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.783676  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4661  hypothetical protein  94.17 
 
 		 540 bp  149  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2943    100 
 
 		 2890 bp  101  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2106    100 
 
 		 516 bp  99.6  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2038  ggdef domain protein  100 
 
 		 597 bp  99.6  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1662    100 
 
 		 2712 bp  97.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.87789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3956  D-xylose transporter subunit XylF  100 
 
 		 1008 bp  97.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  82.35 
 
 		 735 bp  69.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  84.42 
 
 		 759 bp  58  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0084    100 
 
 		 153 bp  52  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660347  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>