89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3715 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1694    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0579778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2604    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2599    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2513    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2308    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2275    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2160    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0153197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  94.64 
 
 		 522 bp  805    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1769    97.75 
 
 		 726 bp  1114    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.680483  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2733    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1668    97.75 
 
 		 726 bp  1114    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.712309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1639    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1593    98.65 
 
 		 609 bp  961    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1563    97.75 
 
 		 726 bp  1114    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1362    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1300    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1238    99.44 
 
 		 459 bp  694    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1019    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4762    97.75 
 
 		 726 bp  1114    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  100 
 
 		 597 bp  1183    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  96.7 
 
 		 906 bp  1348    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0881    85.66 
 
 		 1169 bp  658    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0016    86.68 
 
 		 840 bp  722    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0304    97.75 
 
 		 726 bp  1114    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0580008  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0232    96.19 
 
 		 840 bp  1316    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135154  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0089    97.75 
 
 		 726 bp  1114    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927604  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0069    96.61 
 
 		 822 bp  1304    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000143037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4926    96.75 
 
 		 819 bp  1267    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04151    100 
 
 		 597 bp  1183    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4756    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4639    96.33 
 
 		 840 bp  1328    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4617    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.418974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4080    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3300    96.19 
 
 		 840 bp  1316    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3110    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3018    96.19 
 
 		 840 bp  1316    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2981    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0145761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0717    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.194126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0697    96.78 
 
 		 765 bp  1221    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000144069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4859    98.79 
 
 		 440 bp  779    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0689    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000564033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0907    96.32 
 
 		 840 bp  1324    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0188998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0251    96.19 
 
 		 840 bp  1316    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0224    97.95 
 
 		 744 bp  1059    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0128    96.19 
 
 		 840 bp  1316    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  96.7 
 
 		 840 bp  1348    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0737    96.57 
 
 		 839 bp  1346    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3715    100 
 
 		 836 bp  1657    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1686    93.53 
 
 		 417 bp  605  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00193131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3326    93.29 
 
 		 417 bp  597  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.783676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3328    98.4 
 
 		 429 bp  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1241    94.17 
 
 		 435 bp  533  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.571069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1922    99.61 
 
 		 339 bp  504  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4661  hypothetical protein  92.86 
 
 		 540 bp  468  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0023    99.16 
 
 		 300 bp  456  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4857    92.23 
 
 		 426 bp  422  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3349  IS911 orfA  91.91 
 
 		 426 bp  414  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04115  hypothetical protein  100 
 
 		 414 bp  147  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04152  predicted protein  100 
 
 		 414 bp  147  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2943    100 
 
 		 2890 bp  101  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2106    100 
 
 		 516 bp  99.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2038  ggdef domain protein  100 
 
 		 597 bp  99.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1662    100 
 
 		 2712 bp  97.6  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.87789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3956  D-xylose transporter subunit XylF  100 
 
 		 1008 bp  97.6  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  91.55 
 
 		 687 bp  93.7  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  89.33 
 
 		 747 bp  85.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  89.39 
 
 		 747 bp  75.8  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  89.39 
 
 		 747 bp  75.8  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  91.23 
 
 		 735 bp  73.8  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  87.69 
 
 		 747 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  87.69 
 
 		 540 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  87.69 
 
 		 747 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  94.74 
 
 		 870 bp  60  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  84.42 
 
 		 759 bp  58  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  86.44 
 
 		 816 bp  54  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  86.44 
 
 		 816 bp  54  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  86.44 
 
 		 816 bp  54  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0084    100 
 
 		 153 bp  52  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660347  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  90.48 
 
 		 831 bp  52  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  90.48 
 
 		 831 bp  52  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  90.48 
 
 		 831 bp  52  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  90.48 
 
 		 831 bp  52  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3971    90 
 
 		 831 bp  48.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  96.88 
 
 		 873 bp  48.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>