84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0016 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1019    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3018    87.74 
 
 		 840 bp  848    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2981    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0145761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2604    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2599    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0128    87.74 
 
 		 840 bp  848    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0224    88.09 
 
 		 744 bp  662    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0251    87.74 
 
 		 840 bp  848    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2513    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0689    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000564033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0697    87.35 
 
 		 765 bp  745    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000144069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0717    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.194126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0907    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0188998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2733    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  88.1 
 
 		 840 bp  872    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1300    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1362    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1563    88.06 
 
 		 726 bp  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1639    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1668    88.06 
 
 		 726 bp  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.712309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1694    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0579778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1769    88.06 
 
 		 726 bp  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.680483  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2160    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0153197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2275    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2308    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3110    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3715    86.68 
 
 		 836 bp  722    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  88.1 
 
 		 906 bp  872    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0881    86.19 
 
 		 1169 bp  745    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0016    100 
 
 		 840 bp  1665    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0304    88.06 
 
 		 726 bp  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0580008  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0232    87.74 
 
 		 840 bp  848    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135154  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0089    88.06 
 
 		 726 bp  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927604  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0069    87.78 
 
 		 822 bp  829    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000143037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4926    87.55 
 
 		 819 bp  791    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4762    88.06 
 
 		 726 bp  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4756    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4639    87.74 
 
 		 840 bp  848    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4617    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.418974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4080    87.86 
 
 		 840 bp  856    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0737    86.52 
 
 		 839 bp  751    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3300    87.74 
 
 		 840 bp  848    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1593    88.22 
 
 		 609 bp  597  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04151    86.78 
 
 		 597 bp  494  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  86.78 
 
 		 597 bp  494  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  86.78 
 
 		 522 bp  488  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1238    89.08 
 
 		 459 bp  460  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1686    87.35 
 
 		 417 bp  402  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00193131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3326    86.86 
 
 		 417 bp  387  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.783676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3328    88.58 
 
 		 429 bp  383  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1922    91.13 
 
 		 339 bp  375  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4857    87.92 
 
 		 426 bp  365  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3349  IS911 orfA  87.92 
 
 		 426 bp  365  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4859    86.17 
 
 		 440 bp  351  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0023    90.49 
 
 		 300 bp  349  8e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4661  hypothetical protein  88.04 
 
 		 540 bp  337  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1241    85.67 
 
 		 435 bp  295  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.571069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04115  hypothetical protein  91.67 
 
 		 414 bp  95.6  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04152  predicted protein  91.67 
 
 		 414 bp  95.6  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  91.55 
 
 		 687 bp  93.7  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  90.54 
 
 		 735 bp  91.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  89.19 
 
 		 816 bp  83.8  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  89.19 
 
 		 816 bp  83.8  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  89.19 
 
 		 816 bp  83.8  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  84.62 
 
 		 831 bp  79.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3971    83.65 
 
 		 831 bp  71.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  88.52 
 
 		 747 bp  65.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  86.76 
 
 		 759 bp  63.9  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  82.52 
 
 		 831 bp  61.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  82.52 
 
 		 831 bp  61.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  82.52 
 
 		 831 bp  61.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  82.52 
 
 		 831 bp  61.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  82.52 
 
 		 831 bp  61.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  87.93 
 
 		 747 bp  60  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  87.93 
 
 		 747 bp  60  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  87.93 
 
 		 747 bp  60  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  87.93 
 
 		 540 bp  60  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  87.93 
 
 		 747 bp  60  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  85.51 
 
 		 846 bp  58  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2076    94.29 
 
 		 171 bp  54  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.157078  hitchhiker  0.00209508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2287  hypothetical protein  94.29 
 
 		 207 bp  54  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  85.25 
 
 		 828 bp  50.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  90 
 
 		 870 bp  48.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>