116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2287 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2287  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  68.66 
 
 		 392 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  68.66 
 
 		 392 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  68.66 
 
 		 392 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  68.66 
 
 		 270 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  68.66 
 
 		 270 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 270 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  68.66 
 
 		 270 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  68.66 
 
 		 270 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  68.66 
 
 		 270 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  68.66 
 
 		 290 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  68.66 
 
 		 290 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  68.66 
 
 		 290 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  68.66 
 
 		 290 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  68.66 
 
 		 290 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  69.12 
 
 		 279 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  67.65 
 
 		 301 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  69.12 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  67.65 
 
 		 279 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4661  hypothetical protein  68.66 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  65.67 
 
 		 289 aa  97.1  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 		 277 aa  95.9  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 		 277 aa  95.9  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 		 277 aa  95.9  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  62.69 
 
 		 244 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  61.19 
 
 		 277 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  58.82 
 
 		 253 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  54.69 
 
 		 276 aa  84.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  53.12 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  53.12 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  53.12 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  53.12 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  53.12 
 
 		 276 aa  80.9  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  56.14 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  53.73 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  53.73 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  53.73 
 
 		 248 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  52.63 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  52.24 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  52.24 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  52.24 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  52.63 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  52.63 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  52.63 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  50 
 
 		 275 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  45.45 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  45.45 
 
 		 284 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2585  putative transposase  48.15 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  40.3 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  44.44 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0093  integrase, putative  44.44 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3229  transposase, truncation  44.44 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  46.3 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  46.3 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  46.3 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  46.3 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  46.3 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  46.3 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  46.3 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  47.92 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  47.92 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  47.92 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  47.92 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  47.92 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  43.1 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  47.92 
 
 		 275 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  47.92 
 
 		 275 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  47.92 
 
 		 275 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  47.92 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  41.07 
 
 		 260 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  41.07 
 
 		 260 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  41.07 
 
 		 260 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  43.64 
 
 		 295 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  43.64 
 
 		 295 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  43.64 
 
 		 295 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  43.64 
 
 		 295 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  43.64 
 
 		 295 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  43.64 
 
 		 295 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  41.67 
 
 		 462 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3040  bacteriophage/transposase fusion protein  39.29 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0034  bacteriophage/transposase fusion protein  39.29 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00236951  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  41.67 
 
 		 399 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1790  hypothetical protein  39.29 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.35129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>