69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2076 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2287  hypothetical protein  100 
 
 		 207 bp  339  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2076    100 
 
 		 171 bp  339  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.157078  hitchhiker  0.00209508 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  81.58 
 
 		 1178 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4335    81.58 
 
 		 1178 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  81.58 
 
 		 813 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  81.58 
 
 		 813 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  81.58 
 
 		 813 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  81.58 
 
 		 813 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  81.58 
 
 		 813 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  81.58 
 
 		 813 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0462    81.58 
 
 		 216 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  81.58 
 
 		 1178 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  81.58 
 
 		 1178 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  81.58 
 
 		 813 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  81.58 
 
 		 813 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  81.58 
 
 		 813 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  81.58 
 
 		 813 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  81.58 
 
 		 813 bp  60  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  81.65 
 
 		 813 bp  58  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  81.65 
 
 		 813 bp  58  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  81.65 
 
 		 813 bp  58  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  81.65 
 
 		 813 bp  58  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  81.65 
 
 		 813 bp  58  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  81.65 
 
 		 813 bp  58  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  81.65 
 
 		 813 bp  58  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  81.65 
 
 		 813 bp  58  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  81.65 
 
 		 813 bp  58  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2981    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0145761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0251    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2733    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2604    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2599    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2513    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2308    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2275    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2160    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0153197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3018    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3110    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3300    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4080    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0016    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4617    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.418974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4639    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4756    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0232    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1694    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0579778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0128    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  94.29 
 
 		 522 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  94.29 
 
 		 687 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0689    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000564033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0717    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.194126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0907    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0188998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1019    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1300    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1362    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1639    94.29 
 
 		 840 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1686    94.29 
 
 		 417 bp  54  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00193131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  84.62 
 
 		 735 bp  50.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4661  hypothetical protein  93.75 
 
 		 540 bp  48.1  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  91.43 
 
 		 906 bp  46.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  86.27 
 
 		 873 bp  46.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  86.27 
 
 		 873 bp  46.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  86.27 
 
 		 870 bp  46.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  86.27 
 
 		 873 bp  46.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  86.27 
 
 		 873 bp  46.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  86.27 
 
 		 873 bp  46.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3326    91.43 
 
 		 417 bp  46.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.783676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  91.43 
 
 		 840 bp  46.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>