171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4335 on replicon NC_011664
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  95.57 
 
 		 813 bp  1326    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  98.77 
 
 		 813 bp  1532    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  94.22 
 
 		 813 bp  1239    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  94.22 
 
 		 813 bp  1239    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  94.22 
 
 		 813 bp  1239    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  94.22 
 
 		 813 bp  1239    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  94.22 
 
 		 813 bp  1239    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  94.22 
 
 		 813 bp  1239    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  94.22 
 
 		 813 bp  1239    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  94.22 
 
 		 813 bp  1239    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  94.22 
 
 		 813 bp  1239    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  95.57 
 
 		 813 bp  1326    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  99.84 
 
 		 612 bp  1197    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  99.14 
 
 		 813 bp  1556    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  99.02 
 
 		 813 bp  1548    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  99.14 
 
 		 813 bp  1556    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  98.89 
 
 		 813 bp  1540    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  99.14 
 
 		 813 bp  1556    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  99.14 
 
 		 813 bp  1556    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4335    100 
 
 		 1178 bp  2335    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  99.07 
 
 		 1178 bp  2248    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  100 
 
 		 813 bp  1612    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4340    98.75 
 
 		 560 bp  1055    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000345949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 1178 bp  2335    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4405    98.75 
 
 		 575 bp  1057    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000306701  normal  0.327024 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  99.32 
 
 		 1178 bp  2272    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  98.65 
 
 		 813 bp  1524    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4652  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 312 bp  618  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0459  transposase IS3/IS911 family protein  99.68 
 
 		 312 bp  611  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4250  transposase IS3/IS911 family protein  99.36 
 
 		 312 bp  603  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233516 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0726  transposase IS3/IS911 family protein  99.36 
 
 		 312 bp  603  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1348  transposase IS3/IS911 family protein  99.36 
 
 		 312 bp  603  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1934  transposase IS3/IS911 family protein  99.36 
 
 		 312 bp  603  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3313  transposase IS3/IS911 family protein  99.36 
 
 		 312 bp  603  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4038  transposase IS3/IS911 family protein  99.36 
 
 		 312 bp  603  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4292  transposase IS3/IS911 family protein  99.36 
 
 		 312 bp  603  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2283  transposase IS3/IS911 family protein  99.36 
 
 		 312 bp  603  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4658  transposase IS3/IS911 family protein  99.04 
 
 		 312 bp  595  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4415  transposase IS3/IS911 family protein  97.42 
 
 		 312 bp  551  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2336  transposase IS3/IS911 family protein  97.42 
 
 		 312 bp  551  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0514936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0684  transposase IS3/IS911 family protein  94.84 
 
 		 312 bp  488  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0754  transposase IS3/IS911 family protein  94.84 
 
 		 312 bp  488  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.899394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0865  transposase IS3/IS911 family protein  94.84 
 
 		 312 bp  488  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1610  transposase IS3/IS911 family protein  94.84 
 
 		 312 bp  488  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2050  transposase IS3/IS911 family protein  94.84 
 
 		 312 bp  488  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.575718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3016  transposase IS3/IS911 family protein  94.84 
 
 		 312 bp  488  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3144  transposase IS3/IS911 family protein  94.84 
 
 		 312 bp  488  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0609516  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3616  transposase IS3/IS911 family protein  94.84 
 
 		 312 bp  488  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4014  transposase IS3/IS911 family protein  94.84 
 
 		 312 bp  488  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0462    100 
 
 		 216 bp  424  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4659  integrase, catalytic region  98.31 
 
 		 132 bp  218  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.63226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  83.96 
 
 		 312 bp  75.8  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  85.71 
 
 		 873 bp  71.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  85.71 
 
 		 873 bp  71.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  85.71 
 
 		 873 bp  71.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  85.71 
 
 		 873 bp  71.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  85.71 
 
 		 873 bp  71.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  92.31 
 
 		 303 bp  71.9  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3351  transposase IS3/IS911 family protein  92 
 
 		 369 bp  67.9  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4856  IS911, transposase orfA  92 
 
 		 303 bp  67.9  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0651  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 		 300 bp  63.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0987  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 		 300 bp  63.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4607  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 		 300 bp  63.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28850  hypothetical protein  100 
 
 		 315 bp  63.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000267375  decreased coverage  0.000000000178046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  100 
 
 		 309 bp  63.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2287  hypothetical protein  81.58 
 
 		 207 bp  60  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1361  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3958  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 		 306 bp  60  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.98909  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 		 306 bp  60  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3981  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 		 306 bp  60  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403658  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4090  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 		 306 bp  60  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0406  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 		 306 bp  60  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0647  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 		 306 bp  60  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1000  transposase IS3/IS911 family protein  97.06 
 
 		 306 bp  60  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2076    81.58 
 
 		 171 bp  60  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.157078  hitchhiker  0.00209508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>