32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0462 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0462    100 
 
 
216 bp  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
1178 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
1178 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  100 
 
 
813 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  100 
 
 
813 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  100 
 
 
813 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  100 
 
 
813 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  100 
 
 
813 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  100 
 
 
813 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  100 
 
 
813 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  100 
 
 
813 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  100 
 
 
813 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  100 
 
 
813 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  100 
 
 
813 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4335    100 
 
 
1178 bp  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  99.53 
 
 
1178 bp  416  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  95.33 
 
 
813 bp  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  95.33 
 
 
813 bp  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  95.33 
 
 
813 bp  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  95.33 
 
 
813 bp  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  95.33 
 
 
813 bp  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  95.33 
 
 
813 bp  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  95.33 
 
 
813 bp  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  95.33 
 
 
813 bp  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  95.33 
 
 
813 bp  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  85.71 
 
 
873 bp  71.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  85.71 
 
 
873 bp  71.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  85.71 
 
 
873 bp  71.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  85.71 
 
 
873 bp  71.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  85.71 
 
 
873 bp  71.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2076    81.58 
 
 
171 bp  60  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.157078  hitchhiker  0.00209508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2287  hypothetical protein  81.58 
 
 
207 bp  60  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>