209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0881 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  85.24 
 
 
840 bp  682    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0016    86.19 
 
 
840 bp  745    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3715    85.66 
 
 
836 bp  658    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1639    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0717    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.194126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4639    85 
 
 
840 bp  666    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4080    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0128    85 
 
 
840 bp  666    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4756    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0907    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0188998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2599    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2604    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2733    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0069    84.96 
 
 
822 bp  646    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000143037  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0232    85 
 
 
840 bp  666    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2275    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2513    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2308    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3110    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3300    85 
 
 
840 bp  666    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0689    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000564033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0251    85 
 
 
840 bp  666    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1019    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1300    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1694    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0579778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0881    100 
 
 
1169 bp  2317    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  86.09 
 
 
906 bp  797    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2160    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0153197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0737    85.7 
 
 
839 bp  704    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1362    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4617    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.418974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2981    85.12 
 
 
840 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0145761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3018    85 
 
 
840 bp  666    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4926    84.7 
 
 
819 bp  609  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0697    84.66 
 
 
765 bp  563  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000144069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1668    85.05 
 
 
726 bp  533  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.712309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1563    85.05 
 
 
726 bp  533  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0089    85.05 
 
 
726 bp  533  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927604  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0304    85.05 
 
 
726 bp  533  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0580008  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1769    85.05 
 
 
726 bp  533  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.680483  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4762    85.05 
 
 
726 bp  533  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0224    84.87 
 
 
744 bp  502  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  85.82 
 
 
522 bp  448  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1593    84.81 
 
 
609 bp  440  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  92.41 
 
 
303 bp  418  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3351  transposase IS3/IS911 family protein  93.54 
 
 
369 bp  387  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04151    83.97 
 
 
597 bp  383  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  83.97 
 
 
597 bp  383  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4856  IS911, transposase orfA  93.61 
 
 
303 bp  385  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3326    86.09 
 
 
417 bp  367  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.783676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4859    86.23 
 
 
440 bp  361  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4925  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4755  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  89.77 
 
 
303 bp  355  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1686    85.61 
 
 
417 bp  351  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00193131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  89.44 
 
 
303 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2980    89.44 
 
 
523 bp  347  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0192958  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0015  IS911, transposase orfA  89.22 
 
 
306 bp  341  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1361  IS911, transposase orfA  89.11 
 
 
303 bp  339  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  89.11 
 
 
303 bp  339  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  89.11 
 
 
303 bp  339  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1238    84.63 
 
 
459 bp  313  5.9999999999999995e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4765  transposase OrfA  88.93 
 
 
309 bp  309  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4661  hypothetical protein  86.79 
 
 
540 bp  297  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04145  IS911 protein  88.32 
 
 
273 bp  281  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3349  IS911 orfA  84.76 
 
 
426 bp  280  9e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4857    84.76 
 
 
426 bp  280  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04109  hypothetical protein  87.92 
 
 
264 bp  264  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3718  transposase IS3/IS911 family protein  87.89 
 
 
267 bp  262  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>