85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0069 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1686    100 
 
 		 417 bp  783    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00193131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2599    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2513    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2308    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2275    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2160    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0153197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  100 
 
 		 522 bp  991    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1769    100 
 
 		 726 bp  1362    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.680483  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1694    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0579778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2604    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1668    100 
 
 		 726 bp  1362    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.712309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1639    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1593    100 
 
 		 609 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1563    100 
 
 		 726 bp  1362    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1362    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1300    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1241    99.44 
 
 		 435 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.571069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1238    100 
 
 		 459 bp  813    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1019    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4762    100 
 
 		 726 bp  1362    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  98.18 
 
 		 597 bp  1001    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  99.63 
 
 		 906 bp  1598    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0881    84.96 
 
 		 1169 bp  646    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0016    87.78 
 
 		 840 bp  829    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0304    100 
 
 		 726 bp  1362    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0580008  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0232    99.88 
 
 		 840 bp  1614    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135154  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0089    100 
 
 		 726 bp  1362    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927604  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0069    100 
 
 		 822 bp  1629    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000143037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4926    100 
 
 		 819 bp  1576    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04151    98.18 
 
 		 597 bp  1001    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4756    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4639    99.88 
 
 		 840 bp  1614    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4617    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.418974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4080    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3300    99.88 
 
 		 840 bp  1614    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3110    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3018    99.88 
 
 		 840 bp  1614    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2981    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0145761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2733    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0717    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.194126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0697    99.74 
 
 		 765 bp  1499    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000144069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0689    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000564033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3715    96.61 
 
 		 836 bp  1304    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0251    99.88 
 
 		 840 bp  1614    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0224    100 
 
 		 744 bp  1271    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0128    99.88 
 
 		 840 bp  1614    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0907    100 
 
 		 840 bp  1622    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0188998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  99.63 
 
 		 840 bp  1598    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3326    98.48 
 
 		 417 bp  735    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.783676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3328    97.78 
 
 		 429 bp  648    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0737    93.33 
 
 		 839 bp  1168    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4661  hypothetical protein  100 
 
 		 540 bp  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1922    100 
 
 		 339 bp  615  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4859    94.18 
 
 		 440 bp  593  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0023    98.28 
 
 		 300 bp  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4857    91.62 
 
 		 426 bp  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3349  IS911 orfA  91.62 
 
 		 426 bp  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  100 
 
 		 687 bp  97.6  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  92.86 
 
 		 747 bp  79.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  91.53 
 
 		 747 bp  77.8  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  91.53 
 
 		 747 bp  77.8  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04152  predicted protein  94 
 
 		 414 bp  75.8  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04115  hypothetical protein  94 
 
 		 414 bp  75.8  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  89.83 
 
 		 747 bp  69.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  89.83 
 
 		 540 bp  69.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  89.83 
 
 		 747 bp  69.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  83 
 
 		 759 bp  63.9  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  81.51 
 
 		 735 bp  61.9  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  92.68 
 
 		 816 bp  58  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  92.68 
 
 		 816 bp  58  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  92.68 
 
 		 816 bp  58  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  87.5 
 
 		 831 bp  56  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  87.5 
 
 		 831 bp  56  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  83.75 
 
 		 783 bp  56  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  83.75 
 
 		 783 bp  56  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  83.75 
 
 		 783 bp  56  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  87.5 
 
 		 831 bp  56  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  87.5 
 
 		 831 bp  56  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  92.11 
 
 		 870 bp  52  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  93.75 
 
 		 873 bp  48.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  93.75 
 
 		 873 bp  48.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  93.75 
 
 		 873 bp  48.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  93.75 
 
 		 873 bp  48.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  93.75 
 
 		 873 bp  48.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>