60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4857 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_0737    99.44 
 
 
839 bp  698    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3349  IS911 orfA  99.06 
 
 
426 bp  813    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4857    100 
 
 
426 bp  844    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3328    93.01 
 
 
429 bp  609  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  92.24 
 
 
840 bp  494  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  92.24 
 
 
906 bp  494  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2308    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1563    91.62 
 
 
726 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1593    91.62 
 
 
609 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1639    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1668    91.62 
 
 
726 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.712309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1694    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0579778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1769    91.62 
 
 
726 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.680483  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4617    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.418974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4080    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2160    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0153197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2275    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3018    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3300    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2513    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2599    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3110    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2604    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2733    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2981    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0145761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1300    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0304    91.62 
 
 
726 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0580008  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0232    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135154  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0089    91.62 
 
 
726 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927604  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0069    91.62 
 
 
822 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000143037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4926    91.62 
 
 
819 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4762    91.62 
 
 
726 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4756    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0128    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0224    91.62 
 
 
744 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0251    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0689    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000564033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0697    91.62 
 
 
765 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000144069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0717    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.194126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0907    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0188998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1019    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1238    91.62 
 
 
459 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1362    91.62 
 
 
840 bp  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4639    91.34 
 
 
840 bp  464  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  92.23 
 
 
597 bp  422  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1922    93.17 
 
 
339 bp  422  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3715    92.23 
 
 
836 bp  422  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04151    92.23 
 
 
597 bp  422  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0023    92.76 
 
 
300 bp  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0016    87.92 
 
 
840 bp  365  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0881    84.76 
 
 
1169 bp  280  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0026    100 
 
 
480 bp  129  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144429  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0015    100 
 
 
480 bp  129  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0054    100 
 
 
480 bp  129  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0481234  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0018  IS629, transposase orfB, truncation  100 
 
 
111 bp  129  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483075  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4842    98.46 
 
 
480 bp  121  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.553346  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0116  putative transposase, truncation  93.06 
 
 
126 bp  103  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213246  hitchhiker  8.40547e-75 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3157    92.31 
 
 
468 bp  89.7  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.749394  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  100 
 
 
522 bp  61.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>