52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_D0054 on replicon NC_009788
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 888 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  95.66 
 
 		 891 bp  680    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  96.63 
 
 		 891 bp  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  96.63 
 
 		 888 bp  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  96.63 
 
 		 891 bp  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  95.18 
 
 		 891 bp  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  95.66 
 
 		 891 bp  680    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  96.63 
 
 		 891 bp  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  97.11 
 
 		 888 bp  728    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  95.42 
 
 		 891 bp  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  96.39 
 
 		 888 bp  704    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  96.63 
 
 		 888 bp  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  96.63 
 
 		 888 bp  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  96.87 
 
 		 888 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2665  transposase  97.11 
 
 		 690 bp  728    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236219 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  97.11 
 
 		 891 bp  728    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0054    100 
 
 		 480 bp  952    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0481234  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0015    99.58 
 
 		 480 bp  936    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0026    100 
 
 		 480 bp  952    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4842    96.88 
 
 		 480 bp  833    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.553346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  95.42 
 
 		 888 bp  672    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  99.52 
 
 		 891 bp  807    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  97.35 
 
 		 891 bp  735    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  95.42 
 
 		 891 bp  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  96.63 
 
 		 891 bp  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  95.18 
 
 		 891 bp  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  96.39 
 
 		 891 bp  704    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  95.18 
 
 		 891 bp  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  95.42 
 
 		 891 bp  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0214    96.16 
 
 		 564 bp  613  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0081    96.43 
 
 		 669 bp  333  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000841675  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0059    96.43 
 
 		 669 bp  333  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0018  IS629, transposase orfB, truncation  100 
 
 		 111 bp  220  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483075  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3349  IS911 orfA  100 
 
 		 426 bp  129  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4857    100 
 
 		 426 bp  129  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3328    100 
 
 		 429 bp  129  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0019  hypothetical protein  100 
 
 		 204 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.692933  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0116  putative transposase, truncation  93.85 
 
 		 126 bp  97.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213246  hitchhiker  8.40547e-75 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3157    92.31 
 
 		 468 bp  89.7  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.749394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>