53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3157 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3157    100 
 
 		 468 bp  928    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.749394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4202    82.44 
 
 		 825 bp  232  7e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0116  putative transposase, truncation  98.46 
 
 		 126 bp  121  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213246  hitchhiker  8.40547e-75 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0365    84.52 
 
 		 561 bp  117  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  84.52 
 
 		 867 bp  117  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  84.52 
 
 		 867 bp  117  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1239    84.52 
 
 		 540 bp  117  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    84.42 
 
 		 1163 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  84.42 
 
 		 897 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2260    84.42 
 
 		 834 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  84.42 
 
 		 816 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    84.42 
 
 		 1163 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0074    84.42 
 
 		 868 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1773    84.42 
 
 		 868 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627034  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0079    84.42 
 
 		 868 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0082    84.42 
 
 		 868 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0254232  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  84.42 
 
 		 807 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1145    84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  84.42 
 
 		 867 bp  115  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  83.87 
 
 		 624 bp  109  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0356  transposase  88.66 
 
 		 528 bp  105  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4578    88.66 
 
 		 207 bp  105  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4663    88.66 
 
 		 207 bp  105  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0213    82.8 
 
 		 250 bp  97.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1228    88.76 
 
 		 854 bp  97.6  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0018  IS629, transposase orfB, truncation  92.31 
 
 		 111 bp  89.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483075  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4878    89.61 
 
 		 534 bp  89.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461894 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3349  IS911 orfA  92.31 
 
 		 426 bp  89.7  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0054    92.31 
 
 		 480 bp  89.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0481234  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0015    92.31 
 
 		 480 bp  89.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0026    92.31 
 
 		 480 bp  89.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144429  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4857    92.31 
 
 		 426 bp  89.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3328    92.31 
 
 		 429 bp  89.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0198    86.67 
 
 		 641 bp  83.8  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  85.57 
 
 		 585 bp  81.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4842    90.77 
 
 		 480 bp  81.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.553346  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0074    88.71 
 
 		 399 bp  67.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376988 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0214    87.76 
 
 		 564 bp  50.1  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>