43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0213 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0213    100 
 
 		 250 bp  496  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    90.69 
 
 		 1163 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  90.69 
 
 		 897 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    90.69 
 
 		 1163 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2260    90.69 
 
 		 834 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  90.69 
 
 		 807 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1145    90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0082    90.69 
 
 		 868 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0254232  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0079    90.69 
 
 		 868 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0074    90.69 
 
 		 868 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  90.69 
 
 		 816 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  90.69 
 
 		 867 bp  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1773    91.44 
 
 		 868 bp  244  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  91.44 
 
 		 867 bp  244  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0074    87.36 
 
 		 399 bp  178  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376988 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  94.12 
 
 		 585 bp  155  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0198    88.8 
 
 		 641 bp  129  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  81.62 
 
 		 867 bp  97.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3157    82.8 
 
 		 468 bp  97.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.749394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1239    81.42 
 
 		 540 bp  93.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0365    88.75 
 
 		 561 bp  87.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  81.07 
 
 		 867 bp  81.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  87.5 
 
 		 624 bp  79.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3141  hypothetical protein  83.78 
 
 		 240 bp  77.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0214    100 
 
 		 564 bp  69.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4202    82.73 
 
 		 825 bp  67.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1228    81.98 
 
 		 854 bp  61.9  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0356  transposase  78.69 
 
 		 528 bp  54  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3158    93.94 
 
 		 1509 bp  50.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>