18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3158 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3347  RNA-directed DNA polymerase  98.63 
 
 		 1146 bp  2048    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0017  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  98.67 
 
 		 1509 bp  2833    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485362  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0055  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  98.67 
 
 		 1509 bp  2833    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0016  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  98.74 
 
 		 1524 bp  2841    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.934591  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0025  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  98.74 
 
 		 1524 bp  2841    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3327  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  98.74 
 
 		 1509 bp  2841    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4841  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  98.81 
 
 		 1509 bp  2849    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4858  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  98.67 
 
 		 1509 bp  2833    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3158    100 
 
 		 1509 bp  2991    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0118    90.17 
 
 		 527 bp  502  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000992019  hitchhiker  9.50651e-69 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0212    84.88 
 
 		 240 bp  161  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3154    86.36 
 
 		 945 bp  79.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.32744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8256  reverse transcriptase-like protein  86.67 
 
 		 837 bp  69.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00326311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2025    85.19 
 
 		 1475 bp  65.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2395    85.19 
 
 		 1460 bp  65.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  81.15 
 
 		 1512 bp  60  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4498  RNA-directed DNA polymerase  84 
 
 		 1515 bp  54  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0213    93.94 
 
 		 250 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>