58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0365 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0365    100 
 
 		 561 bp  1112    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0417    96.55 
 
 		 471 bp  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00057901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  98.75 
 
 		 867 bp  1053    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  99.82 
 
 		 624 bp  1100    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  97.32 
 
 		 867 bp  989    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1240    99.25 
 
 		 333 bp  515  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.268129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1239    95.18 
 
 		 540 bp  505  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1228    82.54 
 
 		 854 bp  325  8e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  81.65 
 
 		 867 bp  293  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  81.65 
 
 		 867 bp  293  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  81.65 
 
 		 816 bp  293  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  81.65 
 
 		 867 bp  293  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  81.65 
 
 		 867 bp  293  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0356  transposase  97.02 
 
 		 528 bp  293  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    81.65 
 
 		 1163 bp  293  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  81.65 
 
 		 897 bp  293  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    81.65 
 
 		 1163 bp  293  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  81.65 
 
 		 867 bp  293  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  81.65 
 
 		 867 bp  293  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  81.65 
 
 		 867 bp  293  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  81.65 
 
 		 867 bp  293  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  81.65 
 
 		 867 bp  293  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  81.65 
 
 		 807 bp  293  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  81.65 
 
 		 867 bp  293  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  81.65 
 
 		 867 bp  293  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  81.47 
 
 		 867 bp  285  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  81.47 
 
 		 867 bp  285  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  81.47 
 
 		 867 bp  285  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1145    81.47 
 
 		 867 bp  285  7.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  81.47 
 
 		 867 bp  285  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0074    81.51 
 
 		 868 bp  280  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0082    81.51 
 
 		 868 bp  280  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0254232  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1773    81.51 
 
 		 868 bp  280  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  81.29 
 
 		 867 bp  278  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0079    81.33 
 
 		 868 bp  272  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  81.63 
 
 		 585 bp  258  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2260    81.01 
 
 		 834 bp  246  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4877    93.96 
 
 		 216 bp  224  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.672818  hitchhiker  0.00547052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4579    93.24 
 
 		 216 bp  214  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4664    93.24 
 
 		 216 bp  214  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3159    81.56 
 
 		 432 bp  180  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4202    82.52 
 
 		 825 bp  123  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3157    84.52 
 
 		 468 bp  117  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.749394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4878    88.39 
 
 		 534 bp  111  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461894 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0059    82.39 
 
 		 265 bp  97.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0074    85.45 
 
 		 399 bp  91.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376988 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0213    88.75 
 
 		 250 bp  87.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0306  IS3 family element, transposase orfB  86.05 
 
 		 153 bp  75.8  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0261857  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3141  hypothetical protein  86.3 
 
 		 240 bp  65.9  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0198    84.62 
 
 		 641 bp  60  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4298  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  96.88 
 
 		 171 bp  56  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  84.85 
 
 		 816 bp  52  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  84.85 
 
 		 816 bp  52  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  84.85 
 
 		 816 bp  52  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  84.85 
 
 		 816 bp  52  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 804 bp  48.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 804 bp  48.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 810 bp  48.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>