52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0417 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  95.91 
 
 		 867 bp  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  96.82 
 
 		 624 bp  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  97.03 
 
 		 867 bp  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0417    100 
 
 		 471 bp  934    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00057901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0365    96.55 
 
 		 561 bp  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1240    97.6 
 
 		 333 bp  597  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.268129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1228    86.2 
 
 		 854 bp  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4877    93.52 
 
 		 216 bp  317  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.672818  hitchhiker  0.00547052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  83.94 
 
 		 867 bp  313  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  83.94 
 
 		 807 bp  313  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  83.94 
 
 		 897 bp  313  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    83.94 
 
 		 1163 bp  313  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4579    93.06 
 
 		 216 bp  309  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  83.71 
 
 		 816 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    83.71 
 
 		 1163 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  83.71 
 
 		 867 bp  305  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4664    92.59 
 
 		 216 bp  301  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0082    83.75 
 
 		 868 bp  299  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0254232  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1773    83.75 
 
 		 868 bp  299  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  83.48 
 
 		 867 bp  297  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1145    83.48 
 
 		 867 bp  297  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0074    83.52 
 
 		 868 bp  291  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0079    83.52 
 
 		 868 bp  291  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3159    83.33 
 
 		 432 bp  274  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  82.81 
 
 		 585 bp  274  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4202    85.35 
 
 		 825 bp  224  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2260    82.2 
 
 		 834 bp  192  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1239    93.97 
 
 		 540 bp  167  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0059    83.95 
 
 		 265 bp  167  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0306  IS3 family element, transposase orfB  86.27 
 
 		 153 bp  137  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0261857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4298  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  94.37 
 
 		 171 bp  109  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1229    98.25 
 
 		 57 bp  105  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1151    91.67 
 
 		 48 bp  63.9  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2767    82.83 
 
 		 129 bp  61.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1458  hypothetical protein  93.94 
 
 		 150 bp  50.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0074    91.67 
 
 		 399 bp  48.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376988 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 810 bp  48.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 804 bp  48.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 804 bp  48.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>