25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2767 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2767    100 
 
 		 129 bp  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4202    83.81 
 
 		 825 bp  73.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1240    82.83 
 
 		 333 bp  61.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.268129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0417    82.83 
 
 		 471 bp  61.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00057901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  82.83 
 
 		 867 bp  61.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  82.83 
 
 		 624 bp  61.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3159    82.35 
 
 		 432 bp  60  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  81.82 
 
 		 867 bp  54  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0074    89.13 
 
 		 868 bp  52  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4877    81.63 
 
 		 216 bp  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.672818  hitchhiker  0.00547052 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  80.81 
 
 		 585 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0306  IS3 family element, transposase orfB  86.96 
 
 		 153 bp  44.1  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0261857  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1228    80.39 
 
 		 854 bp  44.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    86.96 
 
 		 1163 bp  44.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  86.96 
 
 		 897 bp  44.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4298  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  83.87 
 
 		 171 bp  44.1  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  86.96 
 
 		 867 bp  44.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  86.96 
 
 		 867 bp  44.1  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  86.96 
 
 		 867 bp  44.1  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  86.96 
 
 		 867 bp  44.1  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  86.96 
 
 		 867 bp  44.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1773    86.96 
 
 		 868 bp  44.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627034  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0082    86.96 
 
 		 868 bp  44.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0254232  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0079    86.96 
 
 		 868 bp  44.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  86.96 
 
 		 807 bp  44.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>