43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1229 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1229    100 
 
 		 57 bp  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4202    98.25 
 
 		 825 bp  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0417    98.25 
 
 		 471 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00057901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  98.25 
 
 		 867 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1240    98.25 
 
 		 333 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.268129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  98.25 
 
 		 624 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  98.25 
 
 		 867 bp  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4877    96.49 
 
 		 216 bp  97.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.672818  hitchhiker  0.00547052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4579    96.49 
 
 		 216 bp  97.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4664    94.74 
 
 		 216 bp  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0059    97.92 
 
 		 265 bp  87.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1228    92.98 
 
 		 854 bp  81.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3159    92.98 
 
 		 432 bp  81.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  95.83 
 
 		 867 bp  79.8  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  95.83 
 
 		 897 bp  79.8  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    95.83 
 
 		 1163 bp  79.8  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0306  IS3 family element, transposase orfB  95.83 
 
 		 153 bp  79.8  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0261857  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  95.83 
 
 		 585 bp  79.8  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  95.83 
 
 		 867 bp  79.8  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  95.83 
 
 		 867 bp  79.8  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  95.83 
 
 		 867 bp  79.8  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  95.83 
 
 		 867 bp  79.8  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1773    95.83 
 
 		 868 bp  79.8  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  95.83 
 
 		 807 bp  79.8  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0082    95.83 
 
 		 868 bp  79.8  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0254232  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0079    95.83 
 
 		 868 bp  79.8  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  93.75 
 
 		 867 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 867 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  93.75 
 
 		 867 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  93.75 
 
 		 867 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    93.75 
 
 		 1163 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  93.75 
 
 		 867 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  93.75 
 
 		 867 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  93.75 
 
 		 867 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  93.75 
 
 		 867 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0074    93.75 
 
 		 868 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  93.75 
 
 		 867 bp  71.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1145    93.75 
 
 		 867 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  93.75 
 
 		 867 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  93.75 
 
 		 867 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  93.75 
 
 		 816 bp  71.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1151    91.67 
 
 		 48 bp  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1458  hypothetical protein  93.94 
 
 		 150 bp  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>