52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4664 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4664    100 
 
 		 216 bp  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.200653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4579    97.69 
 
 		 216 bp  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1240    93.52 
 
 		 333 bp  317  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.268129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  93.52 
 
 		 624 bp  317  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  92.59 
 
 		 867 bp  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  92.59 
 
 		 867 bp  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0417    92.59 
 
 		 471 bp  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00057901 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4877    91.83 
 
 		 216 bp  278  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.672818  hitchhiker  0.00547052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3159    88.89 
 
 		 432 bp  218  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0365    93.24 
 
 		 561 bp  214  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1228    87.3 
 
 		 854 bp  184  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4202    87.01 
 
 		 825 bp  168  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  85.88 
 
 		 585 bp  153  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    85.31 
 
 		 1163 bp  145  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  85.31 
 
 		 867 bp  145  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  85.31 
 
 		 897 bp  145  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  85.31 
 
 		 867 bp  145  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  85.31 
 
 		 807 bp  145  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  84.75 
 
 		 816 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    84.75 
 
 		 1163 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1145    84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  84.75 
 
 		 867 bp  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0079    84.83 
 
 		 868 bp  131  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0082    84.83 
 
 		 868 bp  131  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0254232  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1773    84.83 
 
 		 868 bp  131  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627034  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0074    84.27 
 
 		 868 bp  123  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0059    85.48 
 
 		 265 bp  103  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0306  IS3 family element, transposase orfB  85.71 
 
 		 153 bp  101  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0261857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4298  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  91.55 
 
 		 171 bp  93.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1229    94.74 
 
 		 57 bp  89.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2260    86.11 
 
 		 834 bp  63.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1458  hypothetical protein  96.97 
 
 		 150 bp  58  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  90.24 
 
 		 861 bp  50.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  90.24 
 
 		 603 bp  50.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  90.24 
 
 		 861 bp  50.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  90.24 
 
 		 861 bp  50.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  90.24 
 
 		 861 bp  50.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  90.24 
 
 		 861 bp  50.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1151    87.5 
 
 		 48 bp  48.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>