76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0198 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0198    100 
 
 		 641 bp  1271    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    90.39 
 
 		 1163 bp  771    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    90.24 
 
 		 1163 bp  763    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  95.66 
 
 		 897 bp  601  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0079    95.58 
 
 		 868 bp  549  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2260    95.58 
 
 		 834 bp  549  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1145    95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  95.58 
 
 		 867 bp  549  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  95.28 
 
 		 867 bp  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0082    95.28 
 
 		 868 bp  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0254232  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0074    94.99 
 
 		 868 bp  533  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1773    94.99 
 
 		 868 bp  533  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627034  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0073    96.33 
 
 		 299 bp  500  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  95.14 
 
 		 816 bp  456  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  94.98 
 
 		 807 bp  438  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  88 
 
 		 300 bp  309  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0214    89.95 
 
 		 564 bp  234  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  95.71 
 
 		 300 bp  230  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  95.71 
 
 		 300 bp  230  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  95.71 
 
 		 300 bp  230  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  95.71 
 
 		 309 bp  230  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  95 
 
 		 309 bp  222  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  95 
 
 		 309 bp  222  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01519    95 
 
 		 267 bp  222  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1227  transposase IS3/IS911 family protein  84.33 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  95 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  95 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.078573 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  95 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  95 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  95 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  95 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  95 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  95 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  95 
 
 		 309 bp  222  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  95 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  95 
 
 		 309 bp  222  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  95 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  95 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  95 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  95 
 
 		 300 bp  222  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4705    96.83 
 
 		 132 bp  218  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  85.28 
 
 		 297 bp  212  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0074    88.89 
 
 		 399 bp  149  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376988 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  85.71 
 
 		 867 bp  131  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0213    88.8 
 
 		 250 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  85.62 
 
 		 867 bp  123  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0356  transposase  84.93 
 
 		 528 bp  115  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1239    84.25 
 
 		 540 bp  107  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4878    93.24 
 
 		 534 bp  107  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461894 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1228    90.24 
 
 		 854 bp  99.6  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3157    86.67 
 
 		 468 bp  83.8  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.749394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0357  IS3 transposase OrfA  92.98 
 
 		 300 bp  81.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2944  IS3, transposase orfA  92.98 
 
 		 300 bp  81.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.3441799999999996e-27 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4578    85.39 
 
 		 207 bp  73.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  91.23 
 
 		 300 bp  73.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1117  IS3 OrfA  91.23 
 
 		 300 bp  73.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4663    85.39 
 
 		 207 bp  73.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4202    87.88 
 
 		 825 bp  67.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0423    81.74 
 
 		 236 bp  61.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  84.62 
 
 		 624 bp  60  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0365    84.62 
 
 		 561 bp  60  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  100 
 
 		 585 bp  52  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>