148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3156 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  100 
 
 		 99 aa  194  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1227  transposase IS3/IS911 family protein  92.93 
 
 		 99 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0357  IS3 transposase OrfA  83.84 
 
 		 99 aa  163  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  82.83 
 
 		 99 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  84.85 
 
 		 98 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  81.82 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  81.82 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  81.82 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  81.82 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  81.82 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  81.82 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  81.82 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  81.82 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  81.82 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  81.82 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  81.82 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.078573 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  81.82 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  81.82 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  81.82 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  81.82 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  81.82 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  81.82 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  81.82 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2944  IS3, transposase orfA  80.81 
 
 		 99 aa  156  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.3441799999999996e-27 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1117  IS3 OrfA  80.81 
 
 		 99 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  80.81 
 
 		 99 aa  154  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  80.81 
 
 		 99 aa  154  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  80.81 
 
 		 99 aa  154  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0174  transposase IS3/IS911 family protein  71.74 
 
 		 94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1466  transposase IS3/IS911 family protein  71.74 
 
 		 94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1963  transposase IS3/IS911 family protein  71.74 
 
 		 94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3923  transposase IS3/IS911 family protein  71.74 
 
 		 94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16540  Transposase IS3/IS911  60.44 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20550  Transposase IS3/IS911  60.44 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0615  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 		 97 aa  94  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.511326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1291  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 		 97 aa  94  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06246  hypothetical protein  65.71 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0766  transposase IS3/IS911 family protein  50.51 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1287  transposase IS3/IS911 family protein  50.51 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.439238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40540  Transposase IS3/IS911  58.75 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41880  Transposase IS3/IS911  58.75 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09770  Transposase IS3/IS911  58.75 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4159  putative transposase  77.27 
 
 		 56 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.137992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0651  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0462736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1128  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1988  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.275987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1992  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.203185  normal  0.714899 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1458  hypothetical protein  77.78 
 
 		 49 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2643  transposase IS3/IS911 family protein  32.65 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0189783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198.1  putative transposase  67.44 
 
 		 43 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  39.53 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  38.37 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  38.37 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  38.37 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  38.37 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  38.37 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  38.37 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  38.37 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  38.37 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  38.37 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  38.37 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  38.37 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  38.37 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  38.78 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  38.78 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  40.7 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  40.7 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 		 92 aa  48.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  35 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  35 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  38.54 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  35.05 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0630  transposase IS3/IS911  38.3 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  40.78 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  35.37 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  32.98 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1090  transposase IS3/IS911 family protein  33.67 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1691  transposase IS3/IS911 family protein  33.67 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1954  transposase IS3/IS911 family protein  33.67 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3660  transposase IS3/IS911 family protein  33.67 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3719  transposase IS3/IS911 family protein  33.67 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3739  transposase IS3/IS911 family protein  33.67 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>