258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0083 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  100 
 
 
102 aa  196  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  100 
 
 
102 aa  196  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  100 
 
 
102 aa  196  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  100 
 
 
102 aa  196  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  196  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.078573 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  100 
 
 
99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  98.99 
 
 
99 aa  193  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  98.99 
 
 
99 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  98.99 
 
 
99 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0357  IS3 transposase OrfA  88.89 
 
 
99 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562074  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  87.88 
 
 
99 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2944  IS3, transposase orfA  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.3441799999999996e-27 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1117  IS3 OrfA  84.85 
 
 
99 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1227  transposase IS3/IS911 family protein  83.84 
 
 
99 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  79.8 
 
 
98 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  81.82 
 
 
99 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1466  transposase IS3/IS911 family protein  64.52 
 
 
94 aa  123  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0174  transposase IS3/IS911 family protein  64.52 
 
 
94 aa  123  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3923  transposase IS3/IS911 family protein  64.52 
 
 
94 aa  123  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1963  transposase IS3/IS911 family protein  64.52 
 
 
94 aa  123  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20550  Transposase IS3/IS911  60.44 
 
 
92 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16540  Transposase IS3/IS911  60.44 
 
 
92 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0615  transposase IS3/IS911 family protein  53.54 
 
 
97 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.511326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1291  transposase IS3/IS911 family protein  53.54 
 
 
97 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0766  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 
97 aa  94.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1287  transposase IS3/IS911 family protein  49.49 
 
 
97 aa  90.9  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.439238  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06246  hypothetical protein  58.57 
 
 
70 aa  86.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09770  Transposase IS3/IS911  58.75 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40540  Transposase IS3/IS911  58.75 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41880  Transposase IS3/IS911  58.75 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4159  putative transposase  75.56 
 
 
56 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.137992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0651  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0462736  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1128  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1988  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.275987  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1992  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.203185  normal  0.714899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2643  transposase IS3/IS911 family protein  34.69 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0189783  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1458  hypothetical protein  75 
 
 
49 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  34.83 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198.1  putative transposase  65 
 
 
43 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 
99 aa  50.8  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  38.37 
 
 
90 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  38.37 
 
 
90 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  38.37 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  38.37 
 
 
90 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  38.37 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  36.56 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  36.56 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  36.05 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  36.84 
 
 
98 aa  47.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  36.84 
 
 
98 aa  47.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  36.05 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  35.58 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  35.58 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4232  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1555  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1331  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2819  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00530673  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2306  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2986  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3585  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4634  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0619  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4619  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4643  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>