37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0073 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0073    100 
 
 
299 bp  593  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0198    96.33 
 
 
641 bp  500  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  88.43 
 
 
300 bp  278  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  92.99 
 
 
300 bp  216  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  92.99 
 
 
300 bp  216  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  92.99 
 
 
300 bp  216  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  92.99 
 
 
309 bp  216  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    92.99 
 
 
1163 bp  216  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4705    96.03 
 
 
132 bp  210  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  92.36 
 
 
309 bp  208  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    92.36 
 
 
1163 bp  208  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01519    92.36 
 
 
267 bp  208  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  92.36 
 
 
300 bp  208  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  92.36 
 
 
300 bp  208  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  92.36 
 
 
300 bp  208  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.078573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  92.36 
 
 
300 bp  208  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  92.36 
 
 
309 bp  208  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  92.36 
 
 
300 bp  208  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  92.36 
 
 
300 bp  208  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  92.36 
 
 
300 bp  208  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  92.36 
 
 
300 bp  208  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  92.36 
 
 
300 bp  208  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  92.36 
 
 
300 bp  208  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  92.36 
 
 
300 bp  208  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  92.36 
 
 
309 bp  208  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  92.36 
 
 
309 bp  208  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  92.36 
 
 
300 bp  208  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  92.36 
 
 
300 bp  208  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  84.91 
 
 
297 bp  202  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1227  transposase IS3/IS911 family protein  84.7 
 
 
300 bp  198  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0357  IS3 transposase OrfA  91.23 
 
 
300 bp  73.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562074  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2944  IS3, transposase orfA  91.23 
 
 
300 bp  73.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.3441799999999996e-27 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  95.12 
 
 
300 bp  65.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1117  IS3 OrfA  89.47 
 
 
300 bp  65.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  97.06 
 
 
897 bp  60  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0423    80.87 
 
 
236 bp  54  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4878    93.55 
 
 
534 bp  46.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>