35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01519 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  100 
 
 
309 bp  529  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  100 
 
 
309 bp  529  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
300 bp  529  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    100 
 
 
1163 bp  529  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
300 bp  529  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.078573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  100 
 
 
309 bp  529  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01519    100 
 
 
267 bp  529  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  100 
 
 
300 bp  529  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  100 
 
 
300 bp  529  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  100 
 
 
300 bp  529  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
300 bp  529  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
300 bp  529  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
300 bp  529  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
300 bp  529  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
300 bp  529  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  100 
 
 
309 bp  529  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  99.63 
 
 
300 bp  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  99.63 
 
 
300 bp  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    99.63 
 
 
1163 bp  521  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  99.63 
 
 
300 bp  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  99.63 
 
 
309 bp  521  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  99.25 
 
 
300 bp  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  99.25 
 
 
300 bp  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  99.25 
 
 
300 bp  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0198    95 
 
 
641 bp  222  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0073    92.36 
 
 
299 bp  208  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  86.34 
 
 
300 bp  145  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2944  IS3, transposase orfA  82.58 
 
 
300 bp  143  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.3441799999999996e-27 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0357  IS3 transposase OrfA  82.58 
 
 
300 bp  143  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562074  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  82.35 
 
 
300 bp  133  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  86.18 
 
 
297 bp  131  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1117  IS3 OrfA  81.44 
 
 
300 bp  119  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1227  transposase IS3/IS911 family protein  83.97 
 
 
300 bp  93.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4878    83.33 
 
 
534 bp  83.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461894 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1458  hypothetical protein  82.11 
 
 
150 bp  54  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>