30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0423 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0423    100 
 
 		 236 bp  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  85.71 
 
 		 300 bp  83.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  83.33 
 
 		 297 bp  63.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0198    81.74 
 
 		 641 bp  61.9  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4705    80.83 
 
 		 132 bp  56  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0073    80.87 
 
 		 299 bp  54  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  87.04 
 
 		 300 bp  52  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02658    87.5 
 
 		 1163 bp  48.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.404747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01372    87.5 
 
 		 1163 bp  48.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282168  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  87.5 
 
 		 309 bp  48.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.078573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  87.5 
 
 		 309 bp  48.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  87.5 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  87.5 
 
 		 309 bp  48.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  87.5 
 
 		 309 bp  48.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  87.5 
 
 		 309 bp  48.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>