43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0359 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  91.42 
 
 		 804 bp  1047    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  91.42 
 
 		 804 bp  1047    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  91.42 
 
 		 810 bp  1047    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0359    100 
 
 		 804 bp  1594    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2845    88.78 
 
 		 854 bp  448  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3398  integrase catalytic region  82.74 
 
 		 600 bp  327  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  95.45 
 
 		 882 bp  71.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  95.45 
 
 		 882 bp  71.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  95.45 
 
 		 882 bp  71.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  95.45 
 
 		 882 bp  71.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  95.45 
 
 		 882 bp  71.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  88.33 
 
 		 852 bp  63.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  88.33 
 
 		 852 bp  63.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0892    88.14 
 
 		 2308 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  88.14 
 
 		 852 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4425  integrase, catalytic region  88.14 
 
 		 606 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  88.14 
 
 		 753 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  84.15 
 
 		 501 bp  60  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 834 bp  58  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 834 bp  58  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  94.59 
 
 		 834 bp  58  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  82.29 
 
 		 876 bp  56  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  82.29 
 
 		 876 bp  56  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  82.29 
 
 		 876 bp  56  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2585  putative transposase  94.29 
 
 		 243 bp  54  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4445  IS3 family transposase  91.89 
 
 		 759 bp  50.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323059  hitchhiker  0.0000497697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  91.89 
 
 		 834 bp  50.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  83.12 
 
 		 873 bp  50.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  85.25 
 
 		 696 bp  50.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4859    96.55 
 
 		 440 bp  50.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  93.94 
 
 		 810 bp  50.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  91.89 
 
 		 882 bp  50.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  91.89 
 
 		 882 bp  50.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  91.89 
 
 		 882 bp  50.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06226  transposase and inactivated derivatives  88.64 
 
 		 558 bp  48.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02274  transposase and inactivated derivatives  88.64 
 
 		 672 bp  48.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01088  transposase and inactivated derivatives  88.64 
 
 		 558 bp  48.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.974261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00574  transposase and inactivated derivatives  88.64 
 
 		 672 bp  48.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3920  integrase, catalytic region  93.75 
 
 		 198 bp  48.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782984 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4549    82.5 
 
 		 135 bp  48.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1147    88.64 
 
 		 774 bp  48.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2964    88.64 
 
 		 774 bp  48.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.458335  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  85 
 
 		 720 bp  48.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>