19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1147 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2964    99.48 
 
 		 774 bp  1503    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.458335  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1147    100 
 
 		 774 bp  1534    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2983    93.18 
 
 		 615 bp  63.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  94.87 
 
 		 834 bp  61.9  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2947    94.87 
 
 		 1052 bp  61.9  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 783 bp  54  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  94.29 
 
 		 828 bp  54  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 783 bp  54  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 783 bp  54  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  88.24 
 
 		 810 bp  54  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  89.13 
 
 		 720 bp  52  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2585  putative transposase  92.11 
 
 		 243 bp  52  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2052  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 1317 bp  50.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 882 bp  50.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 882 bp  50.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 882 bp  50.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 882 bp  50.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 882 bp  50.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0359    88.64 
 
 		 804 bp  48.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>