34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2983 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2983    100 
 
 		 615 bp  1219    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  80.79 
 
 		 846 bp  264  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  81.15 
 
 		 1290 bp  238  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0417    79.96 
 
 		 809 bp  178  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  79.35 
 
 		 810 bp  139  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  83.78 
 
 		 855 bp  103  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4930    81.71 
 
 		 746 bp  87.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3231    81.71 
 
 		 288 bp  87.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3229  transposase, truncation  81.71 
 
 		 315 bp  87.7  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0093  integrase, putative  81.71 
 
 		 315 bp  87.7  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  89.83 
 
 		 846 bp  69.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  89.83 
 
 		 846 bp  69.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  93.62 
 
 		 783 bp  69.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  93.62 
 
 		 783 bp  69.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  93.62 
 
 		 783 bp  69.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  89.83 
 
 		 828 bp  69.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  84.44 
 
 		 828 bp  67.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  83.33 
 
 		 912 bp  67.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2964    93.18 
 
 		 774 bp  63.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.458335  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1147    93.18 
 
 		 774 bp  63.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  89.29 
 
 		 828 bp  63.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  89.29 
 
 		 828 bp  63.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  89.29 
 
 		 828 bp  63.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  89.29 
 
 		 828 bp  63.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  89.29 
 
 		 828 bp  63.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  91.3 
 
 		 819 bp  60  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4254    80 
 
 		 2279 bp  58  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000923948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2585  putative transposase  89.36 
 
 		 243 bp  54  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199145 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 834 bp  54  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2947    88.24 
 
 		 1052 bp  54  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  88.24 
 
 		 834 bp  54  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 834 bp  54  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 834 bp  54  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6784    87.72 
 
 		 153 bp  50.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>