20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6784 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6784    100 
 
 		 153 bp  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3231    95.14 
 
 		 288 bp  230  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0093  integrase, putative  95.14 
 
 		 315 bp  230  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3229  transposase, truncation  95.14 
 
 		 315 bp  230  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4930    95.14 
 
 		 746 bp  230  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4254    91.97 
 
 		 2279 bp  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000923948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  89.78 
 
 		 855 bp  161  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  87.8 
 
 		 828 bp  83.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  87.8 
 
 		 828 bp  83.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  87.8 
 
 		 828 bp  83.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  87.8 
 
 		 828 bp  83.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  87.8 
 
 		 912 bp  83.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  87.8 
 
 		 828 bp  83.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  86.59 
 
 		 846 bp  75.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  86.59 
 
 		 846 bp  75.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  86.59 
 
 		 828 bp  75.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  90 
 
 		 819 bp  71.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2983    87.72 
 
 		 615 bp  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  93.55 
 
 		 846 bp  46.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  84.75 
 
 		 810 bp  46.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>