37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4930 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4467    97.4 
 
 		 2251 bp  819    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4930    100 
 
 		 746 bp  1479    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0093  integrase, putative  100 
 
 		 315 bp  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3229  transposase, truncation  100 
 
 		 315 bp  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3233  putative transposase protein  100 
 
 		 375 bp  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  85.39 
 
 		 855 bp  587  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3231    100 
 
 		 288 bp  571  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4254    90 
 
 		 2279 bp  337  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000923948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3088  putative transposase  99.4 
 
 		 552 bp  321  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000013802  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6784    95.14 
 
 		 153 bp  230  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  85.26 
 
 		 828 bp  204  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  85.26 
 
 		 912 bp  204  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  84.86 
 
 		 828 bp  196  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  84.86 
 
 		 828 bp  196  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  84.86 
 
 		 828 bp  196  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  84.86 
 
 		 828 bp  196  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  83.67 
 
 		 846 bp  172  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  83.67 
 
 		 846 bp  172  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  83.27 
 
 		 828 bp  165  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2983    81.71 
 
 		 615 bp  87.7  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  84.26 
 
 		 846 bp  79.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  80.1 
 
 		 1290 bp  77.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  88.73 
 
 		 819 bp  77.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0417    78.14 
 
 		 809 bp  61.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28870  hypothetical protein  89.8 
 
 		 297 bp  58  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000145235  decreased coverage  0.000000000168739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  52  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  52  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  100 
 
 		 891 bp  52  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  88 
 
 		 783 bp  52  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  100 
 
 		 891 bp  52  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  88 
 
 		 783 bp  52  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  100 
 
 		 891 bp  52  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  88 
 
 		 783 bp  52  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  100 
 
 		 891 bp  52  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  100 
 
 		 891 bp  52  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2585  putative transposase  91.89 
 
 		 243 bp  50.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199145 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  84.06 
 
 		 735 bp  50.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>