40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4254 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4467    95.99 
 
 		 2251 bp  3196    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4254    100 
 
 		 2279 bp  4518    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000923948 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0892    99.73 
 
 		 2308 bp  2886    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4205    100 
 
 		 2288 bp  2884    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  85.4 
 
 		 855 bp  379  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0093  integrase, putative  90 
 
 		 315 bp  337  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3229  transposase, truncation  90 
 
 		 315 bp  337  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4930    90 
 
 		 746 bp  337  8e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3231    89.97 
 
 		 288 bp  335  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3233  putative transposase protein  84.1 
 
 		 375 bp  204  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6784    91.97 
 
 		 153 bp  184  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  86.57 
 
 		 912 bp  176  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  86.07 
 
 		 828 bp  168  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  86.07 
 
 		 828 bp  168  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  86.07 
 
 		 828 bp  168  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  86.07 
 
 		 828 bp  168  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3088  putative transposase  91.6 
 
 		 552 bp  165  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000013802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  85.57 
 
 		 846 bp  161  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  85.57 
 
 		 846 bp  161  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  85.57 
 
 		 828 bp  161  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  85.57 
 
 		 828 bp  161  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  89.53 
 
 		 819 bp  99.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4425  integrase, catalytic region  97.62 
 
 		 606 bp  75.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2836  transposase IS3/IS911 family protein  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  92.16 
 
 		 783 bp  61.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  92.16 
 
 		 783 bp  61.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  92.16 
 
 		 783 bp  61.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0711    90 
 
 		 3753 bp  60  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2983    80 
 
 		 615 bp  58  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  80.83 
 
 		 846 bp  56  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  79.86 
 
 		 810 bp  56  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0417    77.99 
 
 		 809 bp  54  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  82.42 
 
 		 1290 bp  54  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 810 bp  50.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 810 bp  50.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 810 bp  50.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 810 bp  50.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 810 bp  50.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 810 bp  50.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 810 bp  50.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>