13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4205 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0892    99.53 
 
 		 2308 bp  2876    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4205    100 
 
 		 2288 bp  4536    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4254    100 
 
 		 2279 bp  2884    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000923948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4467    99.66 
 
 		 2251 bp  2859    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  84.54 
 
 		 831 bp  377  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1402  putative transposase  93.67 
 
 		 162 bp  234  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1134  integrase catalytic subunit  85.12 
 
 		 354 bp  208  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4634    84.15 
 
 		 492 bp  133  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256227  hitchhiker  0.0000868441 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  79.87 
 
 		 831 bp  123  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0711    90 
 
 		 3753 bp  60  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  83.87 
 
 		 828 bp  58  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  96.88 
 
 		 657 bp  56  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1145  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 843 bp  50.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.631339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>