41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4467 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4205    99.66 
 
 		 2288 bp  2859    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0892    99.37 
 
 		 2308 bp  3358    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4254    95.99 
 
 		 2279 bp  3196    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000923948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4467    100 
 
 		 2251 bp  4462    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3233  putative transposase protein  96.8 
 
 		 375 bp  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4930    97.4 
 
 		 746 bp  819    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  100 
 
 		 852 bp  559  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  84.25 
 
 		 855 bp  307  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  100 
 
 		 753 bp  297  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1788    100 
 
 		 138 bp  272  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.363185 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  87.1 
 
 		 852 bp  268  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  87.1 
 
 		 852 bp  268  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5791  integrase catalytic region  83.51 
 
 		 501 bp  188  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  90.62 
 
 		 846 bp  79.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  90.62 
 
 		 828 bp  79.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  90.62 
 
 		 828 bp  79.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  90.62 
 
 		 912 bp  79.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  90.62 
 
 		 828 bp  79.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  90.62 
 
 		 828 bp  79.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  90.62 
 
 		 828 bp  79.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  90.62 
 
 		 828 bp  79.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  90.62 
 
 		 846 bp  79.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3088  putative transposase  100 
 
 		 552 bp  69.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000013802  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  90.74 
 
 		 876 bp  67.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  92 
 
 		 834 bp  67.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  92 
 
 		 882 bp  67.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  92 
 
 		 882 bp  67.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  92 
 
 		 882 bp  67.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  90.74 
 
 		 876 bp  67.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  90.74 
 
 		 876 bp  67.9  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  90.74 
 
 		 825 bp  67.9  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0711    90 
 
 		 3753 bp  60  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3229  transposase, truncation  100 
 
 		 315 bp  60  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0093  integrase, putative  100 
 
 		 315 bp  60  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28870  hypothetical protein  89.8 
 
 		 297 bp  58  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000145235  decreased coverage  0.000000000168739 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2466  integrase catalytic region  88.46 
 
 		 810 bp  56  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0415  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 696 bp  54  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  87.04 
 
 		 780 bp  52  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3764    94.12 
 
 		 552 bp  52  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0417    87.76 
 
 		 809 bp  50.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  93.94 
 
 		 657 bp  50.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>