More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3088 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I3088  putative transposase  100 
 
 
183 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000013802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  84.29 
 
 
284 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0093  integrase, putative  98.15 
 
 
104 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3229  transposase, truncation  98.15 
 
 
104 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  82.46 
 
 
272 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  78.57 
 
 
275 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  82.76 
 
 
281 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  79.31 
 
 
269 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  79.31 
 
 
269 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  79.31 
 
 
269 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  79.31 
 
 
269 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  79.31 
 
 
269 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  79.31 
 
 
269 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  79.31 
 
 
269 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  80.36 
 
 
269 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  82.76 
 
 
275 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  82.76 
 
 
275 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  83.93 
 
 
303 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  83.93 
 
 
275 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  82.76 
 
 
275 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  82.76 
 
 
275 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  81.03 
 
 
275 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  81.03 
 
 
281 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  73.44 
 
 
244 aa  104  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  78.57 
 
 
429 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  80.36 
 
 
281 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  76.79 
 
 
271 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  76.79 
 
 
271 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  76.79 
 
 
271 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  76.36 
 
 
253 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  73.21 
 
 
252 aa  101  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4661  hypothetical protein  76.36 
 
 
179 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  75 
 
 
277 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  75 
 
 
277 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  73.21 
 
 
277 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  75 
 
 
277 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  76.36 
 
 
279 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  60.56 
 
 
290 aa  99.8  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  60.56 
 
 
290 aa  99.8  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  60.56 
 
 
290 aa  99.8  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  60.56 
 
 
290 aa  99.8  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  60.56 
 
 
290 aa  99.8  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  76.36 
 
 
301 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  76.36 
 
 
279 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  76.36 
 
 
173 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  70 
 
 
248 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  62.32 
 
 
289 aa  97.1  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  70 
 
 
248 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  48.25 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  69.64 
 
 
270 aa  95.5  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  67.86 
 
 
392 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  69.64 
 
 
270 aa  95.5  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  67.86 
 
 
392 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  69.64 
 
 
270 aa  95.5  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  69.64 
 
 
270 aa  95.5  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  69.64 
 
 
270 aa  95.5  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  69.64 
 
 
270 aa  95.5  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  48.25 
 
 
248 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  69.64 
 
 
270 aa  95.5  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  69.64 
 
 
270 aa  95.5  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  67.86 
 
 
392 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  69.64 
 
 
270 aa  95.5  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  48.25 
 
 
248 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  67.86 
 
 
270 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  67.86 
 
 
270 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  67.86 
 
 
270 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  67.86 
 
 
270 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  67.86 
 
 
270 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  67.86 
 
 
270 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  67.86 
 
 
270 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  67.86 
 
 
270 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  67.86 
 
 
270 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  67.86 
 
 
270 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  67.86 
 
 
270 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  69.09 
 
 
278 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  57.53 
 
 
276 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  69.09 
 
 
276 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  69.09 
 
 
276 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  69.09 
 
 
276 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  69.09 
 
 
276 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  69.09 
 
 
276 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  62.69 
 
 
248 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  56.52 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  56.52 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  56.52 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1571  integrase catalytic subunit  65.45 
 
 
283 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1140  integrase catalytic subunit  65.45 
 
 
283 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3491  integrase catalytic subunit  65.45 
 
 
283 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0594  integrase catalytic subunit  65.45 
 
 
283 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0365  integrase catalytic subunit  65.45 
 
 
302 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  52.86 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  52.86 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  52.86 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1194  integrase catalytic region  58.49 
 
 
293 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0470498  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  61.11 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  61.11 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  61.11 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  61.11 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  61.11 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0546  bacteriophage/transposase fusion protein  52.17 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>