More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00574 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00574  transposase and inactivated derivatives  100 
 
 
223 aa  453  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02274  transposase and inactivated derivatives  97.65 
 
 
223 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06226  transposase and inactivated derivatives  98.91 
 
 
185 aa  368  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01088  transposase and inactivated derivatives  98.91 
 
 
185 aa  368  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.974261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  63.29 
 
 
295 aa  258  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  63.29 
 
 
295 aa  258  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  63.29 
 
 
295 aa  258  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  63.29 
 
 
295 aa  258  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  63.29 
 
 
295 aa  258  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  63.29 
 
 
295 aa  258  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  57.42 
 
 
298 aa  235  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  57.42 
 
 
298 aa  235  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  57.42 
 
 
298 aa  235  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  50.94 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  50.94 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  50.94 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  50.94 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  50.94 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  52.08 
 
 
275 aa  193  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  52.08 
 
 
275 aa  193  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  52.08 
 
 
275 aa  193  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  49.49 
 
 
302 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  49.49 
 
 
293 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  49.49 
 
 
302 aa  191  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  49.49 
 
 
293 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  43.06 
 
 
294 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  43.06 
 
 
294 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  43.06 
 
 
294 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  43.06 
 
 
294 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  43.06 
 
 
294 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  47.34 
 
 
281 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.74 
 
 
286 aa  184  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.74 
 
 
286 aa  184  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.74 
 
 
286 aa  184  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.74 
 
 
286 aa  184  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.74 
 
 
286 aa  184  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  47.72 
 
 
297 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  47.72 
 
 
297 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  47.72 
 
 
297 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  47.72 
 
 
297 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  47.72 
 
 
297 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  47.72 
 
 
297 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  47.72 
 
 
297 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  47.72 
 
 
297 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  47.72 
 
 
297 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  47.72 
 
 
297 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  47.72 
 
 
297 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  47.72 
 
 
297 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  47.72 
 
 
297 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  48.19 
 
 
288 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  47.09 
 
 
275 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  47.21 
 
 
296 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  45.24 
 
 
296 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  45.24 
 
 
296 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  45.24 
 
 
296 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  45.24 
 
 
296 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  45.24 
 
 
296 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  45.24 
 
 
296 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  45.24 
 
 
296 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  43.46 
 
 
302 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  49.27 
 
 
291 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1183  integrase catalytic subunit  43.41 
 
 
276 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0773839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2475  integrase catalytic subunit  45.75 
 
 
231 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0180519  normal  0.0292129 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  42.92 
 
 
286 aa  175  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  45.31 
 
 
277 aa  175  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  44.9 
 
 
296 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  45.02 
 
 
289 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  45.02 
 
 
289 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  45.02 
 
 
289 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  44.83 
 
 
280 aa  174  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  41.06 
 
 
270 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  44.83 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  41.06 
 
 
270 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  44.83 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  44.44 
 
 
274 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  46.35 
 
 
296 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  46.35 
 
 
296 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  46.35 
 
 
296 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  46.35 
 
 
296 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  45.07 
 
 
291 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  45.07 
 
 
291 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  45.07 
 
 
291 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  45.07 
 
 
291 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  45.07 
 
 
291 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  45.07 
 
 
291 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.45 
 
 
379 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  45.07 
 
 
291 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  43.13 
 
 
282 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  40.45 
 
 
294 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  47.62 
 
 
286 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  47.62 
 
 
286 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  47.62 
 
 
286 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  47.31 
 
 
296 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  42.08 
 
 
270 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  42.08 
 
 
270 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  47.67 
 
 
271 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  42.65 
 
 
282 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  47.62 
 
 
286 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  42.08 
 
 
270 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  47.31 
 
 
296 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>