42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0209 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0209  transposase  100 
 
 		 75 aa  156  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1165  transposase  86.54 
 
 		 406 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0025  ISL3 family transposase  90.24 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1788  transposase and inactivated derivatives  54 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0526  putative transposase  54 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1444  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  50.98 
 
 		 407 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.551686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.28 
 
 		 407 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.817062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3683  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.28 
 
 		 407 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  47.83 
 
 		 411 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0228  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  41.67 
 
 		 402 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0665  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  41.67 
 
 		 402 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.180609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02786  ISXoo13 transposase  45.65 
 
 		 411 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5539  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  41.51 
 
 		 407 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.704796 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0151  transposase  46.67 
 
 		 418 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2732  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  41.51 
 
 		 407 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03122  transposase  43.48 
 
 		 322 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1055  transposase  46.67 
 
 		 296 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4575  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  41.51 
 
 		 407 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4792  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  41.51 
 
 		 407 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5329  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  41.51 
 
 		 407 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4119  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44.44 
 
 		 417 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0138  transposase  46.67 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1853  transposase  46.67 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0003  transposase  46.67 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0463  transposase  46.67 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0505  transposase  46.67 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0560  transposase  46.67 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1543  transposase  46.67 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1940  transposase  46.67 
 
 		 418 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0399155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01504  ISXoo13 transposase  43.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01758  ISXoo13 transposase  43.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.339943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02212  ISXoo13 transposase  43.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02426  ISXoo13 transposase  43.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01375  ISXoo13 transposase  43.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02978  ISXoo13 transposase  43.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01111  ISXoo13 transposase  43.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04079  ISXoo13 transposase  43.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04142  ISXoo13 transposase  43.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04311  ISXoo13 transposase  43.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04734  ISXoo13 transposase  43.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04847  ISXoo13 transposase  43.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05742  ISXoo13 transposase  43.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>