More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0526 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0526  putative transposase  100 
 
 
406 aa  841    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1788  transposase and inactivated derivatives  98.03 
 
 
411 aa  829    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.81 
 
 
411 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1165  transposase  43.42 
 
 
406 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.35 
 
 
407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.817062  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3683  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.35 
 
 
407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188081  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1444  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.6 
 
 
407 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.551686  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0936  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.9 
 
 
411 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0006  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.9 
 
 
411 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1949  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.65 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.960551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.31 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2732  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  37.72 
 
 
407 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4575  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  37.72 
 
 
407 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4792  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  37.87 
 
 
407 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5329  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  37.62 
 
 
407 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5539  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  37.62 
 
 
407 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.704796 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1922  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.68 
 
 
323 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.180002 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0228  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  33.67 
 
 
402 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0665  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  33.67 
 
 
402 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.180609  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1244  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.77 
 
 
361 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.661907  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4119  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.54 
 
 
417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2939  transposase  34.29 
 
 
371 aa  226  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00230958  normal  0.013078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.33 
 
 
421 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2896  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.97 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158144  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1271  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.97 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4396  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.97 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1834  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.9 
 
 
432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2862  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.8 
 
 
441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3176  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.8 
 
 
441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0333  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.8 
 
 
441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0315  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.9 
 
 
432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677908  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.97 
 
 
389 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3476  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.9 
 
 
431 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418883  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2462  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.68 
 
 
411 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2352  transposase ISL3 family protein  33.01 
 
 
440 aa  209  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0368  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.7 
 
 
441 aa  209  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0254  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.71 
 
 
406 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0652  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.71 
 
 
406 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0716  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.71 
 
 
406 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0872  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.71 
 
 
406 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1079  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.71 
 
 
406 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1664  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.71 
 
 
406 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2270  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.71 
 
 
406 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0736  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.46 
 
 
431 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843016  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2101  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.25 
 
 
413 aa  199  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135516  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1429  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.25 
 
 
413 aa  199  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0658  transposase  31.19 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0748  transposase  31.19 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0642968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1580  transposase  31.19 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000196779  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0299  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.75 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.812028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0086  transposase  31 
 
 
411 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0202  transposase  31 
 
 
411 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0597  transposase  31 
 
 
411 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.600179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0708  transposase  31 
 
 
411 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0765  transposase  31 
 
 
411 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0788  transposase  31 
 
 
411 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0832  transposase  31 
 
 
411 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.108641  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1063  transposase  31 
 
 
411 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1507  transposase  31 
 
 
411 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.667036  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1918  transposase  31 
 
 
411 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1981  transposase  31 
 
 
411 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7486  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.76 
 
 
407 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2612  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.44 
 
 
413 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0697  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.44 
 
 
413 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4115  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.31 
 
 
413 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1380  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.31 
 
 
413 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3181  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.31 
 
 
413 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2284  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.31 
 
 
413 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2326  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.31 
 
 
413 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00136305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0319  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.31 
 
 
413 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0107  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.31 
 
 
413 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1538  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.31 
 
 
413 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4134  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.31 
 
 
413 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00235401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2396  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.31 
 
 
413 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2266  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.31 
 
 
413 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2879  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.31 
 
 
413 aa  189  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.132844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0561  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.31 
 
 
413 aa  189  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.56 
 
 
408 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.520122  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1177  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.56 
 
 
408 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123826  normal  0.601968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.56 
 
 
408 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.56 
 
 
408 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.468712  normal  0.0451791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1174  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.56 
 
 
408 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000815795  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.56 
 
 
408 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0551  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.56 
 
 
408 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.340213  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0599  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.56 
 
 
408 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0373  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.76 
 
 
408 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384224  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0341  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.29 
 
 
408 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.717183  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2200  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.75 
 
 
408 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240905  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2148  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.75 
 
 
408 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.493226  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1867  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.75 
 
 
408 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.90501  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1226  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.75 
 
 
408 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.75 
 
 
408 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.495823 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2843  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.1 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1105  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.1 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0520  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.1 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0847  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.1 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03140  transposase  32.43 
 
 
420 aa  169  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00450  transposase  32.43 
 
 
420 aa  169  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10230  transposase  32.43 
 
 
420 aa  169  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04880  transposase  32.43 
 
 
420 aa  169  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>