More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2646 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3683  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 
407 aa  852    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188081  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 
407 aa  852    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.817062  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1444  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  70.27 
 
 
407 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.551686  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1165  transposase  45.32 
 
 
406 aa  352  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1788  transposase and inactivated derivatives  42.33 
 
 
411 aa  328  7e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0526  putative transposase  41.35 
 
 
406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.98 
 
 
411 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.83 
 
 
406 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0006  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.25 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0936  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.25 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1949  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33 
 
 
411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.960551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4792  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  34.88 
 
 
407 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5329  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  34.88 
 
 
407 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2732  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  35.04 
 
 
407 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4575  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  35.04 
 
 
407 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5539  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  34.63 
 
 
407 aa  216  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.704796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0228  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  27.59 
 
 
402 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0665  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  27.59 
 
 
402 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.180609  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1244  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.58 
 
 
361 aa  201  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.661907  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4119  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.07 
 
 
417 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0254  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.1 
 
 
406 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0652  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.1 
 
 
406 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0716  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.1 
 
 
406 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0872  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.1 
 
 
406 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1079  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.1 
 
 
406 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1664  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.1 
 
 
406 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2270  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.1 
 
 
406 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0658  transposase  29.44 
 
 
411 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0748  transposase  29.44 
 
 
411 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0642968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1580  transposase  29.44 
 
 
411 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000196779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1922  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.08 
 
 
323 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.180002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2462  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.08 
 
 
411 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0086  transposase  28.95 
 
 
411 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0202  transposase  28.95 
 
 
411 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0597  transposase  28.95 
 
 
411 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.600179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0708  transposase  28.95 
 
 
411 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0765  transposase  28.95 
 
 
411 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0788  transposase  28.95 
 
 
411 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0832  transposase  28.95 
 
 
411 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.108641  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1063  transposase  28.95 
 
 
411 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1507  transposase  28.95 
 
 
411 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.667036  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1918  transposase  28.95 
 
 
411 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1981  transposase  28.95 
 
 
411 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2939  transposase  28.57 
 
 
371 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00230958  normal  0.013078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.34 
 
 
421 aa  176  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3176  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30 
 
 
441 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2862  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30 
 
 
441 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0333  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30 
 
 
441 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2396  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.12 
 
 
413 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1380  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.12 
 
 
413 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1538  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.12 
 
 
413 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2326  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.12 
 
 
413 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00136305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4134  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.12 
 
 
413 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00235401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3181  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.12 
 
 
413 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0319  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.12 
 
 
413 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2284  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.12 
 
 
413 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4115  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.12 
 
 
413 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2266  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.12 
 
 
413 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0107  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.12 
 
 
413 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0561  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.12 
 
 
413 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1429  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.9 
 
 
413 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7486  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.27 
 
 
407 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2879  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.12 
 
 
413 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.132844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2101  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.9 
 
 
413 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135516  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0697  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.88 
 
 
413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2612  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.88 
 
 
413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1867  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.38 
 
 
408 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.90501  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1226  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.38 
 
 
408 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.38 
 
 
408 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.495823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2148  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.38 
 
 
408 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.493226  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2200  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.38 
 
 
408 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240905  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0368  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.15 
 
 
441 aa  159  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0736  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.88 
 
 
431 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843016  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0025  ISL3 family transposase  43.85 
 
 
194 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2172  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.8 
 
 
407 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0299  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.91 
 
 
408 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.812028  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2352  transposase ISL3 family protein  28.57 
 
 
440 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2896  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
390 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158144  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4396  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
390 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0315  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
432 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677908  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1271  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
390 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1834  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
432 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0797  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
417 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02212  ISXoo13 transposase  27.83 
 
 
411 aa  149  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05742  ISXoo13 transposase  27.83 
 
 
411 aa  149  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3487  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0487  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0115  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01111  ISXoo13 transposase  27.83 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3253  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2456  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.352628  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01568  ISXoo13 transposase  27.83 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2342  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712759  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04311  ISXoo13 transposase  27.83 
 
 
411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04734  ISXoo13 transposase  27.83 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04847  ISXoo13 transposase  27.83 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02426  ISXoo13 transposase  27.59 
 
 
411 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3476  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
431 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418883  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.57 
 
 
389 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04142  ISXoo13 transposase  27.59 
 
 
411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>