51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0033 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0033    100 
 
 		 135 bp  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1241    97.4 
 
 		 435 bp  137  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.571069  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0057  hypothetical protein  98.31 
 
 		 1773 bp  109  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0209487  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0135    98.31 
 
 		 288 bp  109  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0107  hypothetical protein  97.62 
 
 		 255 bp  75.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 888 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 888 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 888 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 888 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 888 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 888 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 888 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1390  transposase  97.14 
 
 		 249 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.185969 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0056    97.14 
 
 		 447 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0468813  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0017    97.14 
 
 		 447 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473155  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0024    97.14 
 
 		 447 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4840    97.14 
 
 		 447 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0273512  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4874  IS629, transposase orfB, truncation  97.14 
 
 		 111 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  97.14 
 
 		 888 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0059    97.14 
 
 		 669 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0081    97.14 
 
 		 669 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000841675  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0016  IS629, transposase orfB, truncation  97.14 
 
 		 447 bp  61.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  97.14 
 
 		 891 bp  61.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  94.29 
 
 		 891 bp  54  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0007  hypothetical protein  91.43 
 
 		 123 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>