41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0007 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0007  hypothetical protein  100 
 
 		 40 aa  84  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  96.3 
 
 		 296 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  96.3 
 
 		 296 aa  60.5  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  92.59 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  92.59 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  92.59 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  92.59 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  92.59 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  92.59 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  92.59 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  92.59 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  92.59 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  92.59 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  92.59 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  92.59 
 
 		 295 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  92.59 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  92.59 
 
 		 296 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0016  IS629, transposase orfB, truncation  92.59 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1390  transposase  86.21 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.185969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4874  IS629, transposase orfB, truncation  83.33 
 
 		 36 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  88.89 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>